RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 WBP1LQ9NX94 342 aa8.21□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 UNCXA6NJT0 531 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXN1O15353 648 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 NEFLP07196 543 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 GJA5P36382 358 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP3K10Q02779 954 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 VGLL4Q14135 290 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CERS3Q8IU89 383 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 AIDAQ96BJ3 306 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 FSD1Q9BTV5 496 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 PI4KBQ9UBF8 816 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 FLT1P17948 1338 aa8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D12O60347 775 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 TRPA1O75762 1119 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 PDE4AP27815 886 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 TM4SF4P48230 202 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 ERO1BQ86YB8 467 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 APPBP2Q92624 585 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 OSBP2Q969R2 916 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 EVI5LQ96CN4 794 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 OTUD5Q96G74 571 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF186Q9NXI6 227 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 MCM9Q9NXL9 1143 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 TSKSQ9UJT2 592 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.19□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP350Q5VT06 3117 aa8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SIPA1L1O43166 1804 aa8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 NAV1Q8NEY1 1877 aa8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 M0R2C6 588 aa8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 APPP05067 770 aa8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 HLA-DOAP06340 250 aa8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 PLCD1P51178 756 aa8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 INHBEP58166 350 aa8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC6Q86TZ1 520 aa8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 PICK1Q9NRD5 415 aa8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 ATRNL1Q5VV63 1379 aa8.18□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L12C9JPN9 530 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 USP17L21D6R901 530 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D8O95759 1140 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP2D6P10635 497 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPRAP18433 802 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CAP2P40123 477 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 GTF2A2P52657 109 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 LBX1P52954 281 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 JAG1P78504 1218 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 PPATQ06203 517 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SREBF2Q12772 1141 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CCL15Q16663 113 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.17□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 MINDY4BA8MYZ0 360 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM22K7EJ46 135 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 IRF6O14896 467 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 GPAA1O43292 621 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 GDF11O95390 407 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 MYH8P13535 1937 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 SDSP20132 328 aa8.16□□□□□ -1.1
EFTUD2-211ENST00000588374 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms