RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ERO1AQ96HE7 468 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 DCTPP1Q9H773 170 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRIM75PA6NK02 468 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 PDHXO00330 501 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 CXCL11O14625 94 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP5JP18859 108 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 MOGSQ13724 837 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 TLR2O60603 784 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 HLA-DOAP06340 250 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 CAP1Q01518 475 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 HAUS7Q99871 368 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 CPA4Q9UI42 421 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 LAMB1P07942 1786 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHGBP05060 677 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 CAP2P40123 477 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 CERS3Q8IU89 383 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 DNAJC18Q9H819 358 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 GDF11O95390 407 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 SOX10P56693 466 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 EFCC1Q9HA90 598 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 CYP2C8P10632 490 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPP2Q13103 211 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 LCORLQ8N3X6 602 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADD2P35612 726 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 JAG1P78504 1218 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARMT1Q9H993 441 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP17L5A8MUK1 530 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPATCH3Q96I76 525 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.034e-6■□□□□ 11.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 MBD4O95243 580 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 C17orf99Q6UX52 265 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLCD1P51178 756 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 HMGCS2P54868 508 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 EVX2Q03828 476 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF22Q14807 665 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 TREML2Q5T2D2 321 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTC6Q86TZ1 520 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 DOCK1Q14185 1865 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRKAB2O43741 272 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 GH2P01242 217 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ASNSP08243 561 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 CYP2D6P10635 497 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 MTMR2Q13614 643 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGEF6Q15052 776 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SIPA1L1O43166 1804 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 EHD4Q9H223 541 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 CTGFP29279 349 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 UBE3CQ15386 1083 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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