RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 TBC1D8O95759 1140 aa22.48■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 PPATQ06203 517 aa22.48■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 PPIL2Q13356 520 aa22.48■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.48■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.48■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 MBD4O95243 580 aa22.47■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 GTF2A2P52657 109 aa22.47■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.47■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.46■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 PRKAB2O43741 272 aa22.46■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 NUCB1Q02818 461 aa22.46■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 CCL15Q16663 113 aa22.46■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.46■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.46■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.46■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAJC18Q9H819 358 aa22.46■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 PICK1Q9NRD5 415 aa22.46■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 STAP2Q9UGK3 403 aa22.46■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 SIPA1L1O43166 1804 aa22.45■■□□□ 1.19
GCSHP2-201ENST00000560971 PTPRAP18433 802 aa22.45■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 PDE1AP54750 535 aa22.45■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 LAMB1P07942 1786 aa22.45■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 HLA-DOAP06340 250 aa22.44■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 SNAPC2Q13487 334 aa22.44■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.44■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 ALDH1A1P00352 501 aa22.43■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 CETPP11597 493 aa22.43■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.43■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 MYH7P12883 1935 aa22.42■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 CAP2P40123 477 aa22.42■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 PLCD1P51178 756 aa22.42■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 JAG1P78504 1218 aa22.42■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 EVX2Q03828 476 aa22.42■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.42■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.42■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 OSBP2Q969R2 916 aa22.42■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.42■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.42■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 TTC6Q86TZ1 520 aa22.41■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 TNS4Q8IZW8 715 aa22.41■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 FSD1Q9BTV5 496 aa22.41■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.41■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.41■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 MYH1P12882 1939 aa22.41■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 BTBD19C9JJ37 291 aa22.4■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 CYP2D6P10635 497 aa22.4■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 APPBP2Q92624 585 aa22.4■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 EHD4Q9H223 541 aa22.4■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.4■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.4■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 DOCK1Q14185 1865 aa22.4■■□□□ 1.18
GCSHP2-201ENST00000560971 M0R2C6 588 aa22.39■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 GDF11O95390 407 aa22.39■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 CRHR2Q13324 411 aa22.39■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 MOGSQ13724 837 aa22.39■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.39■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.39■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.39■■□□□ 1.17
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GCSHP2-201ENST00000560971 TRIM75PA6NK02 468 aa22.38■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 GPR25O00155 361 aa22.38■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 CXCL11O14625 94 aa22.38■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.38■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.37■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 EVI5LQ96CN4 794 aa22.37■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.36■■□□□ 1.17
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GCSHP2-201ENST00000560971 GPAA1O43292 621 aa22.36■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L5A8MUK1 530 aa22.35■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L12C9JPN9 530 aa22.35■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L21D6R901 530 aa22.35■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 SHMT1P34896 483 aa22.35■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 GABPAQ06546 454 aa22.35■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 SPP2Q13103 211 aa22.35■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.35■■□□□ 1.17
GCSHP2-201ENST00000560971 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.35■■□□□ 1.17
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