RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 PI16Q6UXB8 463 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 ANKRD42Q8N9B4 389 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 RIN3Q8TB24 985 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 NKD1Q969G9 470 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 SUSD3Q96L08 255 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 CAMKK2Q96RR4 588 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 SELENOOQ9BVL4 669 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 CDH19Q9H159 772 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 GGNBP2Q9H3C7 697 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 IFT122Q9HBG6 1241 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 A0A087X0B3 334 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 DYTNA2CJ06 578 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 A6NHS1 94 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 KATNA1O75449 491 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 TRIM27P14373 513 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 RHOQP17081 205 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 GSTT1P30711 240 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 HTR3AP46098 478 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 FAM83BQ5T0W9 1011 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 ERAP2Q6P179 960 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 NXPE4Q6UWF7 544 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 UBR7Q8N806 425 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 OR6P1Q8NGX9 317 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 SCLT1Q96NL6 688 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 HERPUD2Q9BSE4 406 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 SUV39H2Q9H5I1 410 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 PPP4R2Q9NY27 417 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 MAPRE3Q9UPY8 281 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 USP20Q9Y2K6 914 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 BICDL2A1A5D9 508 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 PRRT4C9JH25 899 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 UBAP1LF5GYI3 381 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 GPR25O00155 361 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 PAX4O43316 350 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 RFPL3O75679 317 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 IDH3AP50213 366 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 ITKQ08881 620 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 LRP8Q14114 963 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 SEPT6Q14141 434 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 IL31Q6EBC2 164 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 FBXL19Q6PCT2 694 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 CCDC81Q6ZN84 652 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 ZNF438Q7Z4V0 828 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 NECAB2Q7Z6G3 386 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 RNF180Q86T96 592 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 ZNF280CQ8ND82 737 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 CHMP4CQ96CF2 233 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 HOOK2Q96ED9 719 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 GMCL1Q96IK5 515 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 HSH2DQ96JZ2 352 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 SLC26A8Q96RN1 970 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 BCO2Q9BYV7 579 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 PRDM11Q9NQV5 511 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 KCNQ5Q9NR82 932 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 STRN4Q9NRL3 753 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 LUZP4Q9P127 313 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-232ENST00000552331 POLG2Q9UHN1 485 aa4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms