RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 LIG1P18858 919 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CTR9Q6PD62 1173 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 BRAPQ7Z569 592 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 USP28Q96RU2 1077 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 SRGNP10124 158 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 DPEP1P16444 411 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 SEC23AQ15436 765 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 MYL10Q9BUA6 226 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 FOCADQ5VW36 1801 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 UFL1O94874 794 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 IFNAR1P17181 557 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 SBK1Q52WX2 424 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 TMC4Q7Z404 712 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ALG1Q9BT22 464 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 GGA1Q9UJY5 639 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 JAG2Q9Y219 1238 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 TNKSO95271 1327 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L12C9JPN9 530 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L21D6R901 530 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM22K7EJ46 135 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 IL1R1P14778 569 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 BICD2Q8TD16 824 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 PHKBQ93100 1093 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 MASTLQ96GX5 879 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CD209Q9NNX6 404 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 DACT1Q9NYF0 836 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ORC4O43929 436 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 NPR1P16066 1061 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 KCNA3P22001 575 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 GSTO1P78417 241 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 PPP2R5BQ15173 497 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 RTN1Q16799 776 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 RNF214Q8ND24 703 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 AIFM3Q96NN9 605 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 MYH1P12882 1939 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 KIF28PB7ZC32 967 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 MAP3K11Q16584 847 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 UVSSAQ2YD98 709 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 KRT40Q6A162 431 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 PIM2Q9P1W9 311 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-208ENST00000502484 NR1I2O75469 434 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 YEATS4O95619 227 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 PPP4CP60510 307 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 IQCA1Q86XH1 822 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 SP8Q8IXZ3 490 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 FANCBQ8NB91 859 aa9.52□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.52□□□□□ -0.89
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PDE4D-208ENST00000502484 POLLQ9UGP5 575 aa9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 LDHCP07864 332 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC192P0DO97 292 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 ALDH1B1P30837 517 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 NT5C2P49902 561 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 STYK1Q6J9G0 422 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 NBPF11Q86T75 865 aa9.51□□□□□ -0.89
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