RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 PHF20L1A8MW92 1017 aa39.48■■■■□ 3.91
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CHKB-210ENST00000484266 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
CHKB-210ENST00000484266 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP39.48■■■■□ 3.91
CHKB-210ENST00000484266 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
CHKB-210ENST00000484266 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
CHKB-210ENST00000484266 SLC10A4Q96EP9 437 aa39.48■■■■□ 3.91
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CHKB-210ENST00000484266 ATAD5Q96QE3 1844 aa39.42■■■■□ 3.9
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CHKB-210ENST00000484266 USP17L21D6R901 530 aa39.4■■■■□ 3.9
CHKB-210ENST00000484266 TRIM34Q9BYJ4 488 aa39.4■■■■□ 3.9
CHKB-210ENST00000484266 MAP2K2P36507 400 aa39.4■■■■□ 3.9
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CHKB-210ENST00000484266 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa39.4■■■■□ 3.9
CHKB-210ENST00000484266 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa39.39■■■■□ 3.9
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CHKB-210ENST00000484266 SCYL3Q8IZE3 742 aa39.38■■■■□ 3.89
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CHKB-210ENST00000484266 SMIM22K7EJ46 135 aa39.36■■■■□ 3.89
CHKB-210ENST00000484266 BMP2KLQ5H9B9 411 aa39.36■■■■□ 3.89
CHKB-210ENST00000484266 VPS53Q5VIR6 699 aa39.36■■■■□ 3.89
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CHKB-210ENST00000484266 MYH8P13535 1937 aa39.34■■■■□ 3.89
CHKB-210ENST00000484266 CAP2P40123 477 aa39.34■■■■□ 3.89
CHKB-210ENST00000484266 TATDN1Q6P1N9 297 aa39.34■■■■□ 3.89
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CHKB-210ENST00000484266 CHMLP26374 656 aa39.33■■■■□ 3.89
CHKB-210ENST00000484266 PHIPQ8WWQ0 1821 aa39.33■■■■□ 3.89
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CHKB-210ENST00000484266 PICK1Q9NRD5 415 aa39.32■■■■□ 3.89
CHKB-210ENST00000484266 NAPBQ9H115 298 aa39.31■■■■□ 3.88
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CHKB-210ENST00000484266 SLC44A5Q8NCS7 719 aa39.31■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 IL25Q9H293 177 aa39.31■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 TAOK2Q9UL54 1235 aa39.31■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 PPIL2Q13356 520 aa39.3■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 SWAP70Q9UH65 585 aa39.3■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 MINDY4BA8MYZ0 360 aa39.29■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 JAG1P78504 1218 aa39.29■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 GDF11O95390 407 aa39.28■■■■□ 3.88
CHKB-210ENST00000484266 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
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