RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363143.1

RNU6-623P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 623, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-623P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-623P-201ENST00000363143 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 GIPC1O14908 333 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 FANCGO15287 622 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 KCNA1Q09470 495 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 FBRSQ9HAH7 460 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 LRRC14Q15048 493 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 SPG7Q9UQ90 795 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 SAMM50Q9Y512 469 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 SLITRK5O94991 958 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 C8AP07357 584 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 PICK1Q9NRD5 415 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 ATP2B2Q01814 1243 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 NKG7Q16617 165 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-623P-201ENST00000363143 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 PRR33A8MZF0 331 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 SV2BQ7L1I2 683 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 FZD5Q13467 585 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 RIN3Q8TB24 985 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 LRIG2O94898 1065 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 GNA15P30679 374 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 JAG1P78504 1218 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 FAM168AQ92567 244 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 BIN1O00499 593 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 GFRA2O00451 464 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZP2Q05996 745 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 IKZF1Q13422 519 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 SEPT6Q14141 434 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 HDXQ7Z353 690 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 KCT2Q8NC54 265 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 ASB11Q8WXH4 323 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 FOXQ1Q9C009 403 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 CAP2P40123 477 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 MIPEPQ99797 713 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 AK5Q9Y6K8 562 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-623P-201ENST00000363143 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZNF124Q15973 351 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 MAP3K11Q16584 847 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 FRMD6Q96NE9 622 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 GRK4P32298 578 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 CLCN7P51798 805 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 FGD1P98174 961 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-623P-201ENST00000363143 FYB2Q5VWT5 728 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms