RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBE3DQ7Z6J8 389 aa4.37□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 SHISA5Q8N114 240 aa4.37□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 ELMO3Q96BJ8 720 aa4.37□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 YIPF2Q9BWQ6 316 aa4.37□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 LGR6Q9HBX8 967 aa4.37□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa4.37□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa4.37□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa4.37□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 FANCGO15287 622 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 CILPO75339 1184 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 F13A1P00488 732 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADMP35318 185 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBM25P49756 843 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAP7Q14244 749 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF394Q53GI3 561 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNAP47Q5SQN1 464 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 LCE4AQ5TA78 99 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXL19Q6PCT2 694 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 HDXQ7Z353 690 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 GOLM1Q8NBJ4 401 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXO27Q8NI29 283 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 GATAD2BQ8WXI9 593 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 GATA6Q92908 595 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF34Q969K3 372 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 MFSD14AQ96MC6 490 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCNQ5Q9NR82 932 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1GALT1Q9NS00 363 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 GSC2O15499 205 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 F13BP05160 661 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 RACK1P63244 317 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 C9orf131Q5VYM1 1079 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 NBPF11Q86T75 865 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBC1D32Q96NH3 1257 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 DBNDD2Q9BQY9 259 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 PICK1Q9NRD5 415 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 TLR3O15455 904 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 GREM1O60565 184 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRK4P32298 578 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDK5R2Q13319 367 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM196AQ6ZSG2 479 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZAR1Q86SH2 424 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 USP48Q86UV5 1035 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXL6Q8N531 539 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF507Q8TCN5 953 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBRSQ9HAH7 460 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 CORINQ9Y5Q5 1042 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 TACC3Q9Y6A5 838 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRR19A6NJB7 356 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM170BA6NMN3 283 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 WDR64B1ANS9 1081 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRKP46108 304 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 MPP2Q14168 576 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 NKG7Q16617 165 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC51AQ86UW1 340 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 NT5DC4Q86YG4 428 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC3Q9BY71 257 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRIN3BO60391 1043 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 LEFTY1O75610 366 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 BPNT1O95861 308 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 TGFB1P01137 390 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 PGRP06401 933 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 OGFOD3Q6PK18 319 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 REC114Q7Z4M0 266 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIAA0825Q8IV33 1275 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCT2Q8NC54 265 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPON2Q9BUD6 331 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBP1Q9NZI7 540 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 ROBO2Q9HCK4 1378 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRR36Q9H6K5 1346 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM87AP0C7U9 286 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLCG1P19174 1290 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 CAP2P40123 477 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-227P-201ENST00000362865 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms