RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 FGD1P98174 961 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 VEZTQ9HBM0 779 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 PRDM1O75626 825 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 PCP11498 1178 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 PDE4BQ07343 736 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 TTC6Q86TZ1 520 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 DYNLL2Q96FJ2 89 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 PRC1O43663 620 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 KDM4AO75164 1064 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 Q6ZUG5 572 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXA4-201ENST00000360046 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.83■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.83■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD1Q15327 319 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 ESR2Q92731 530 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 ENTPD3O75355 529 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 HLA-DOAP06340 250 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 ANTXR2P58335 489 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 FGRP09769 529 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 ORC4O43929 436 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 HACL1Q9UJ83 578 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 BRF1Q92994 677 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 MYH8P13535 1937 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 TMX3Q96JJ7 454 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 CDK8P49336 464 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 FAM151AQ8WW52 585 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
HOXA4-201ENST00000360046 CNTNAP1P78357 1384 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 SIPA1L1O43166 1804 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM87BQ96K49 555 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 TSPY2A6NKD2 308 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 EPHX2P34913 555 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 TNNI2P48788 182 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 FAM47AQ5JRC9 791 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 CSRNP1Q96S65 589 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 EHD4Q9H223 541 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 FAM83AQ86UY5 434 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 ERICH2A1L162 156 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 GABPAQ06546 454 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 APOBRQ0VD83 1088 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 TNFAIP1Q13829 316 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 SWAP70Q9UH65 585 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 RASA1P20936 1047 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 TFAP4Q01664 338 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 IQCA1Q86XH1 822 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 FBXL16Q8N461 479 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXA4-201ENST00000360046 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms