RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 CDC25BP30305 580 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 LIFRP42702 1097 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 MAP3K11Q16584 847 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 APOA5Q6Q788 366 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 TOMM22Q9NS69 142 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 NEMFO60524 1076 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 SLFN14P0C7P3 912 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 PLCB2Q00722 1185 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 TTC6Q86TZ1 520 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 CPLX1O14810 134 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 KRT222Q8N1A0 295 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 SMIM22K7EJ46 135 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 IGSF3O75054 1194 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 TNNT1P13805 278 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 PTGS1P23219 599 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 KIF18AQ8NI77 898 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB43O43298 467 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 RXRAP19793 462 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 TMC4Q7Z404 712 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 SPC24Q8NBT2 197 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 MTA3Q9BTC8 594 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 CD209Q9NNX6 404 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 FAM53CQ9NYF3 392 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 POLLQ9UGP5 575 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 GUCY1B3Q02153 619 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 CTR9Q6PD62 1173 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 MICU3Q86XE3 530 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.53■■□□□ 1.04
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SPNS1-204ENST00000352260 CDC27P30260 824 aa21.52■■□□□ 1.04
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SPNS1-204ENST00000352260 SLC20A2Q08357 652 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 GRIK5Q16478 980 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 SP8Q8IXZ3 490 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC69A6NI79 296 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 MMP10P09238 476 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 IL1R1P14778 569 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 TYRO3Q06418 890 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 TERF2Q15554 542 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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SPNS1-204ENST00000352260 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 NID2Q14112 1375 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 SRGNP10124 158 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 WTAPQ15007 396 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA32Q96LK8 384 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 MYL10Q9BUA6 226 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM51Q9NW97 253 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L12C9JPN9 530 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L21D6R901 530 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 CDKL5O76039 1030 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF75DP51815 510 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 ESR2Q92731 530 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 C8orf76Q96K31 380 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 ERICH2A1L162 156 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB7AO95365 584 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 FGRP09769 529 aa21.49■■□□□ 1.03
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