RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.03■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 BAG3O95817 575 aa22.02■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 SNAPC2Q13487 334 aa22.02■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.02■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTX4-201ENST00000293922 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 CETPP11597 493 aa22.01■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 EVI5LQ96CN4 794 aa22.01■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 PLCG2P16885 1265 aa22■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 PAG1Q9NWQ8 432 aa22■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 CENPFP49454 3210 aa22■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.99■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 TBC1D12O60347 775 aa21.99■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 CYP7A1P22680 504 aa21.99■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.99■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 BTBD19C9JJ37 291 aa21.98■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 GOLIM4O00461 696 aa21.98■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.98■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.98■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 FAM196BA6NMK8 535 aa21.97■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 PTPRAP18433 802 aa21.97■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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PTX4-201ENST00000293922 RILPL2Q969X0 211 aa21.97■■□□□ 1.11
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PTX4-201ENST00000293922 FLT1P17948 1338 aa21.97■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 MOGSQ13724 837 aa21.97■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 TICAM2Q86XR7 235 aa21.97■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.97■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.97■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 PICK1Q9NRD5 415 aa21.97■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.96■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.96■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.96■■□□□ 1.11
PTX4-201ENST00000293922 CXCL11O14625 94 aa21.95■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 SP3Q02447 781 aa21.94■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 FSD1Q9BTV5 496 aa21.94■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.94■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.94■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.93■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 CDC45O75419 566 aa21.93■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 CAP1Q01518 475 aa21.93■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.93■■□□□ 1.1
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PTX4-201ENST00000293922 CERS3Q8IU89 383 aa21.93■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.93■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 ERO1AQ96HE7 468 aa21.93■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 PALD1Q9ULE6 856 aa21.93■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.93■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 SIPA1L1O43166 1804 aa21.93■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 DOCK1Q14185 1865 aa21.93■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 FOCADQ5VW36 1801 aa21.92■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 TLR2O60603 784 aa21.92■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 TRIM17Q9Y577 477 aa21.92■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 PDE6AP16499 860 aa21.91■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.91■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.91■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 DNAJC18Q9H819 358 aa21.91■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 PDHXO00330 501 aa21.9■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 CHMLP26374 656 aa21.9■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 CAP2P40123 477 aa21.9■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
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PTX4-201ENST00000293922 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTX4-201ENST00000293922 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.89■■□□□ 1.1
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PTX4-201ENST00000293922 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.1
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PTX4-201ENST00000293922 BRCA2P51587 3418 aa21.89■■□□□ 1.09
PTX4-201ENST00000293922 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.89■■□□□ 1.09
PTX4-201ENST00000293922 TRIM75PA6NK02 468 aa21.89■■□□□ 1.09
PTX4-201ENST00000293922 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PTX4-201ENST00000293922 USP5P45974 858 aa21.89■■□□□ 1.09
PTX4-201ENST00000293922 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PTX4-201ENST00000293922 EFCC1Q9HA90 598 aa21.89■■□□□ 1.09
PTX4-201ENST00000293922 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.88■■□□□ 1.09
PTX4-201ENST00000293922 RGS19P49795 217 aa21.88■■□□□ 1.09
PTX4-201ENST00000293922 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.88■■□□□ 1.09
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