RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 SAR1BQ9Y6B6 198 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 E7EVH7 732 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ALDH3A1P30838 453 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 PLCH2O75038 1416 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 IFT74Q96LB3 600 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 USP44Q9H0E7 712 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNFAIP3P21580 790 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 PZPP20742 1482 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 RUFY4Q6ZNE9 571 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 NLRC4Q9NPP4 1024 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 FANCLQ9NW38 375 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ABCC4O15439 1325 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ITGA6P23229 1130 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 PAK2Q13177 524 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 BRD3Q15059 726 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 STMN2Q93045 179 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 DCAF5Q96JK2 942 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 NUP58Q9BVL2 599 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ARHGAP25P42331 645 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 NGLY1Q96IV0 654 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 PPP1R2P41236 205 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ATP11AP98196 1134 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRT71Q3SY84 523 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 TBC1D7Q9P0N9 293 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A087WWV3 80 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ASIC2Q16515 512 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 VSIG1Q86XK7 387 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 RASEFQ8IZ41 740 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 CETN3O15182 167 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 EPB41P11171 864 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 GUCY2FP51841 1108 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRIM7Q9C029 511 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 A6NNZ2 444 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZAP70P43403 619 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 PSMC4P43686 418 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 TUBB8Q3ZCM7 444 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 CFAP221Q4G0U5 840 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 LDHBP07195 334 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 VWA3BQ502W6 1294 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 EFCAB8A8MWE9 144 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ATP1A2P50993 1020 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 SWAP70Q9UH65 585 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 A2MP01023 1474 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 GNGT1P63211 74 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 INF2Q27J81 1249 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 PCDHA7Q9UN72 937 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 EIF6P56537 245 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 SP4Q02446 784 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 GCKRQ14397 625 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 RRAGAQ7L523 313 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 C2CD5Q86YS7 1000 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 TXNDC16Q9P2K2 825 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 KLHL30Q0D2K2 578 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRAF1Q13077 416 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ADCK5Q3MIX3 580 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 NELFCDQ8IXH7 590 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 CAPN7Q9Y6W3 813 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 LIG3P49916 1009 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 PTPN21Q16825 1174 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 BCAS4Q8TDM0 211 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC10-201ENST00000291574 SSH3Q8TE77 659 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.3 ms