RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
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INO80B-201ENST00000233331 EXOC6Q8TAG9 804 aa37.12■■■■□ 3.53
INO80B-201ENST00000233331 HLA-DOAP06340 250 aa37.11■■■■□ 3.53
INO80B-201ENST00000233331 ADD2P35612 726 aa37.11■■■■□ 3.53
INO80B-201ENST00000233331 CRHR2Q13324 411 aa37.11■■■■□ 3.53
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INO80B-201ENST00000233331 FAM43AQ8N2R8 423 aa37.11■■■■□ 3.53
INO80B-201ENST00000233331 KCNH4Q9UQ05 1017 aa37.11■■■■□ 3.53
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INO80B-201ENST00000233331 PDHXO00330 501 aa36.97■■■■□ 3.51
INO80B-201ENST00000233331 GDF11O95390 407 aa36.97■■■■□ 3.51
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INO80B-201ENST00000233331 ERO1AQ96HE7 468 aa36.95■■■■□ 3.51
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INO80B-201ENST00000233331 GPAT2Q6NUI2 795 aa36.94■■■■□ 3.5
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INO80B-201ENST00000233331 ZNF280CQ8ND82 737 aa36.94■■■■□ 3.5
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INO80B-201ENST00000233331 TLR2O60603 784 aa36.93■■■■□ 3.5
INO80B-201ENST00000233331 IGHDP01880 384 aa36.93■■■■□ 3.5
INO80B-201ENST00000233331 JAG1P78504 1218 aa36.93■■■■□ 3.5
INO80B-201ENST00000233331 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
INO80B-201ENST00000233331 CD99L2Q8TCZ2 262 aa36.93■■■■□ 3.5
INO80B-201ENST00000233331 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa36.93■■■■□ 3.5
INO80B-201ENST00000233331 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
INO80B-201ENST00000233331 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa36.92■■■■□ 3.5
INO80B-201ENST00000233331 LNPKQ9C0E8 428 aa36.92■■■■□ 3.5
INO80B-201ENST00000233331 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa36.92■■■■□ 3.5
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