RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 SBK1Q52WX2 424 aa22.02■■□□□ 1.12
PRRT1-201ENST00000211413 CERS3Q8IU89 383 aa22.02■■□□□ 1.12
PRRT1-201ENST00000211413 GGA3Q9NZ52 723 aa22.02■■□□□ 1.12
PRRT1-201ENST00000211413 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.02■■□□□ 1.12
PRRT1-201ENST00000211413 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PRRT1-201ENST00000211413 POTEIP0CG38 1075 aa22.02■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 POTEJP0CG39 1038 aa22.02■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.02■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.02■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 NEK1Q96PY6 1258 aa22.02■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 EPHX2P34913 555 aa22.01■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 ANAPC15P60006 121 aa22.01■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.01■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 RRAGCQ9HB90 399 aa22.01■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 SIPA1L1O43166 1804 aa22.01■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 RASA3Q14644 834 aa22■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 FAM47AQ5JRC9 791 aa22■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 FZD1Q9UP38 647 aa22■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.99■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 DNAJC18Q9H819 358 aa21.99■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.99■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 KDM4AO75164 1064 aa21.98■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 ANTXR2P58335 489 aa21.98■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.98■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.98■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 ENTPD3O75355 529 aa21.98■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 CDK8P49336 464 aa21.98■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.98■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 RUFY3Q7L099 469 aa21.98■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 FAM151AQ8WW52 585 aa21.98■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 CSRNP1Q96S65 589 aa21.98■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.98■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.98■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 IL17RAQ96F46 866 aa21.97■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.97■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.97■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 NMT2O60551 498 aa21.96■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 DTNBO60941 627 aa21.96■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 RPS6KB1P23443 525 aa21.96■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 RABEP1Q15276 862 aa21.96■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.96■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 NCOA7Q8NI08 942 aa21.96■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 SENP2Q9HC62 589 aa21.96■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.96■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 KRT32Q14532 448 aa21.96■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 TTC6Q86TZ1 520 aa21.96■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 TEPSINQ96N21 525 aa21.96■■□□□ 1.11
PRRT1-201ENST00000211413 ADM5C9JUS6 153 aa21.95■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 MMP14P50281 582 aa21.95■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 GABPAQ06546 454 aa21.95■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.95■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 TTC14Q96N46 770 aa21.95■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.95■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.95■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.95■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 PSMA5P28066 241 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 TRDNQ13061 729 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 WDR90Q96KV7 1748 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 PRC1O43663 620 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 HLA-DOAP06340 250 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 RASA1P20936 1047 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 AK2P54819 239 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 Q6ZUG5 572 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 SCN4AP35499 1836 aa21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 FGRP09769 529 aa21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 SHMT1P34896 483 aa21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 FAM83AQ86UY5 434 aa21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.93■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 JAG1P78504 1218 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 TFAP4Q01664 338 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 PDE4BQ07343 736 aa21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PRRT1-201ENST00000211413 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms