RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000198767.10

RRN3-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 3,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-201ENST00000198767 SLC12A7Q9Y666 1083 aa10.1□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 GOLGA8AA7E2F4 631 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 SLC26A6Q9BXS9 759 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 BCL9O00512 1426 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 ZNF609O15014 1411 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 UBASH3AP57075 661 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 RCOR1Q9UKL0 485 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 KIF1AQ12756 1690 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 MROH5Q6ZUA9 1318 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 KIF28PB7ZC32 967 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 FOXR1Q6PIV2 292 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 ENGASEQ8NFI3 743 aa10.09□□□□□ -0.79
RRN3-201ENST00000198767 UFL1O94874 794 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 ZNF202O95125 648 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 CSF1RP07333 972 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 KLRK1P26718 216 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 CYP2C19P33261 490 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 VPS72Q15906 364 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 NYXQ9GZU5 481 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 FANCLQ9NW38 375 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 KIAA1468Q9P260 1216 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 RSPH14Q9UHP6 348 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 ETF1P62495 437 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 SLC51AQ86UW1 340 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 PICALMQ13492 652 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 SARM1Q6SZW1 724 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 KRT27Q7Z3Y8 459 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 GPIHBP1Q8IV16 184 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 LCORLQ8N3X6 602 aa10.08□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 JCADQ9P266 1359 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 FDPSP14324 419 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 SYCP1Q15431 976 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 KLHL10Q6JEL2 608 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 GPR108Q9NPR9 543 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 MCM9Q9NXL9 1143 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 RHOXF2BP0C7M4 288 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 PFKFB1P16118 471 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 TAF3Q5VWG9 929 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 AMOTL1Q8IY63 956 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 RASSF8Q8NHQ8 419 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 RHOXF2Q9BQY4 288 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 MKNK2Q9HBH9 465 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 STX8Q9UNK0 236 aa10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 SPTLC2O15270 562 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 ZBTB43O43298 467 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 RPS6KA4O75676 772 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 KCNB2Q92953 911 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 DSCC1Q9BVC3 393 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 H3BQF6 201 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 NTSR2O95665 410 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 TOP1P11387 765 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 CASP1P29466 404 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 CDC25BP30305 580 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 ADD2P35612 726 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 STX17P56962 302 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 FAM47AQ5JRC9 791 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 FKBP15Q5T1M5 1219 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 IFNL3Q8IZI9 196 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 DHX58Q96C10 678 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 VPS18Q9P253 973 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 TSPY2A6NKD2 308 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 NEMFO60524 1076 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 CDC27P30260 824 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 NFIXQ14938 502 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 VAT1LQ9HCJ6 419 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 STRCP1A6NGW2 1772 aa10.06□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 USP17L12C9JPN9 530 aa10.05□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 USP17L21D6R901 530 aa10.05□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 PRDX5P30044 214 aa10.05□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 GSDMDP57764 484 aa10.05□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 PDE4BQ07343 736 aa10.05□□□□□ -0.8
RRN3-201ENST00000198767 WTAPQ15007 396 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms