RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 K7EQZ3 153 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 IGFL1Q6UW32 110 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A087WTM6 91 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF861PO60384 105 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 Q96NJ1 140 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 ERC2-IT1O76042 136 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 MAST4O15021 2626 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 Q8N377 158 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 CEP350Q5VT06 3117 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 ITPR3Q14573 2671 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 ATRQ13535 2644 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 BPTFQ12830 3046 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 PRO0628Q9UI54 55 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 PRR15Q8IV56 129 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 APLNQ9ULZ1 77 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF575Q86XF7 245 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A1B0GVX0 72 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A1W2PNN7 141 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 CHD7Q9P2D1 2997 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 CASC10Q5T4H9 136 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 IGLV7-43P04211 117 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 C4orf26Q17RF5 130 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 CFAP46Q8IYW2 2715 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 DSCR10P59022 87 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 J3QL48 77 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 KLKP1Q107X0 134 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 SPRR4Q96PI1 79 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 COA5Q86WW8 74 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 CENPEQ02224 2701 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A0G2JQZ4 141 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A1W2PNM2 257 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 WIPF1O43516 503 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 LINC01600Q96MT4 127 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 UTRNP46939 3433 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 CHD9Q3L8U1 2897 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 A8MUN3 132 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 UQCR11O14957 56 aa10.11□□□□□ -0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 C9orf92A6NGG3 77 aa10.11□□□□□ -0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM104AQ969W3 186 aa10.11□□□□□ -0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 H7BZZ5 65 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 COX6B2Q6YFQ2 88 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 C5orf42Q9H799 3197 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 TNP2Q05952 138 aa10.05□□□□□ -0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF292O60281 2723 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 STAB1Q9NY15 2570 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 CD164Q04900 197 aa10.02□□□□□ -0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 AKAP13Q12802 2813 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 CR1P17927 2039 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 HTTP42858 3142 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 TRANK1O15050 2925 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 CHD6Q8TD26 2715 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 OCR1Q9BZK8 76 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 MGAQ8IWI9 3026 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 SPRR1AP35321 89 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 PCNTO95613 3336 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.9□□□□□ -0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 Q8N1X5 172 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 COL6A5A8TX70 2615 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 Q8NDZ9 215 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 CRIPTQ9P021 101 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 SPRR1BP22528 89 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 CFAP54Q96N23 3096 aa9.77□□□□□ -0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 Q6ZSA8 131 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 NOTCH1P46531 2555 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.75□□□□□ -0.85
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