RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 RMI2Q96E14 147 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-215ENST00000549143 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CS-215ENST00000549143 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CS-215ENST00000549143 F8W1H4 67 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-215ENST00000549143 SLPIP03973 132 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-215ENST00000549143 ATXN8Q156A1 80 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-215ENST00000549143 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-215ENST00000549143 Q6ZRP5 223 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-215ENST00000549143 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CS-215ENST00000549143 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-215ENST00000549143 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
CS-215ENST00000549143 PRO0461Q9UI25 63 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-215ENST00000549143 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 C2orf48Q96LS8 159 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 CARD19Q96LW7 228 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 SLC25A20O43772 301 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 LINC01620Q4KN68 170 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 RNF151Q2KHN1 245 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.51□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 GAGE2BQ13066 116 aa5.51□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 TMEM126AQ9H061 195 aa5.51□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 LST1O00453 97 aa5.5□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.5□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 NDUFC2O95298 119 aa5.5□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 C6orf99Q4VX62 202 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 MUC7Q8TAX7 377 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 A0A087WYN8 130 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 LY6G6CO95867 125 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 FAM168BA1KXE4 195 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 K7ERU9 68 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 TTC32Q5I0X7 151 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GV72 72 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 DNAL4O96015 105 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 VPREB1P12018 145 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 KMT2AQ03164 3969 aa5.46□□□□□ -1.53
CS-215ENST00000549143 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 TEN1Q86WV5 123 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 H0YGX0 51 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 VPS25Q9BRG1 176 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 IGLV6-57P01721 117 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 F8WDY8 70 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 M0R378 163 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 TRACP01848 142 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 CHTF8P0CG12 524 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 DPH3Q96FX2 82 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 A0A096LNI7 61 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 H3BT86 120 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 J3QR89 54 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 C7orf33Q8WU49 177 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 DIRC1Q969H9 104 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 C14orf177Q52M58 125 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 Q8N814 137 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 C22orf24Q9Y442 160 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
CS-215ENST00000549143 SNCGO76070 127 aa5.4□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 hADV29S1A0JD25 119 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 LINC00575Q6W349 94 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 LINC00167Q96N53 147 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 COX7BP24311 80 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 Q6ZQY7 126 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PNN7 141 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 C16orf90A8MZG2 172 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 Q6ZR54 194 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 A0A087WTM6 91 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 M0QXV9 152 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-215ENST00000549143 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
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