RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	CCK	P06307	115 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-231	ENST00000518681	ENHO	Q6UWT2	76 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-231	ENST00000518681	USP17L23	D6RBM5	183 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-231	ENST00000518681		Q6JHZ5	121 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-231	ENST00000518681	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-231	ENST00000518681	ATOX1	O00244	68 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-231	ENST00000518681	INAFM1	C9JVW0	142 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-231	ENST00000518681	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-231	ENST00000518681	LYRM9	A8MSI8	78 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	TENM3	Q9P273	2699 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681		Q6ZQY7	126 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00575	Q6W349	94 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	RETN	Q9HD89	108 aa		12.74	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	NDUFC2	O95298	119 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681		Q8NAQ8	132 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	COX17	Q14061	63 aa		12.73	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00167	Q96N53	147 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	HAMP	P81172	84 aa		12.72	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	SCX	Q7RTU7	201 aa		12.71	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	GHRH	P01286	108 aa		12.71	□□□□□ -0.37
MIB2-231	ENST00000518681	NOTCH1	P46531	2555 aa		12.71	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	APOC4	P55056	127 aa		12.7	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	SERP2	Q8N6R1	65 aa		12.7	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		12.7	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	DSCR8	Q96T75	97 aa		12.7	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		12.69	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		12.69	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	UBL5	Q9BZL1	73 aa		12.69	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	STAB1	Q9NY15	2570 aa		12.69	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		12.68	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	CRYGA	P11844	174 aa		12.68	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	UPK3B	Q9BT76	320 aa		12.68	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	MAST4	O15021	2626 aa		12.68	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	F8	P00451	2351 aa		12.68	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	LELP1	Q5T871	98 aa		12.67	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681		J3QKU1	62 aa		12.66	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681		Q6ZQT0	140 aa		12.65	□□□□□ -0.38
MIB2-231	ENST00000518681	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		12.64	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		12.64	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681	IGLV6-57	P01721	117 aa		12.63	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681	C20orf197	Q8N268	126 aa		12.63	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		12.63	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681	ANK2	Q01484	3957 aa		12.62	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		12.62	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681	MIF	P14174	115 aa		12.62	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		12.62	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681	DIRC1	Q969H9	104 aa		12.6	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681		A0A0J9YWU9	116 aa		12.6	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681	PRR34	Q9NV39	138 aa		12.6	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681		Q6ZVQ6	151 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681		Q6ZRU5	148 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MIB2-231	ENST00000518681	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		12.58	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681		Q6ZTC4	211 aa		12.58	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681		J3KT08	172 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681	OXT	P01178	125 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681	COX7B	P24311	80 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681		Q8N9L7	120 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681	SNURF	Q9Y675	71 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681	MUC7	Q8TAX7	377 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681	DPH3	Q96FX2	82 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MIB2-231	ENST00000518681	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-231	ENST00000518681	VPREB1	P12018	145 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MIB2-231	ENST00000518681	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-231	ENST00000518681	COL6A5	A8TX70	2615 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MIB2-231	ENST00000518681	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-231	ENST00000518681	ESRG	Q1W209	222 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-231	ENST00000518681	C15orf56	Q8N910	161 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-231	ENST00000518681		Q6ZRP5	223 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM258	P61165	79 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MIB2-231	ENST00000518681	C3orf84	H3BNL1	204 aa		12.46	□□□□□ -0.41
MIB2-231	ENST00000518681	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP10-11	P60412	298 aa		12.46	□□□□□ -0.42
MIB2-231	ENST00000518681	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
MIB2-231	ENST00000518681	RMI2	Q96E14	147 aa		12.45	□□□□□ -0.42
MIB2-231	ENST00000518681	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		12.45	□□□□□ -0.42
MIB2-231	ENST00000518681	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		12.44	□□□□□ -0.42
MIB2-231	ENST00000518681	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		12.44	□□□□□ -0.42
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		12.44	□□□□□ -0.42
MIB2-231	ENST00000518681	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		12.43	□□□□□ -0.42
MIB2-231	ENST00000518681	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		12.42	□□□□□ -0.42
MIB2-231	ENST00000518681	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		12.42	□□□□□ -0.42
MIB2-231	ENST00000518681		M0R378	163 aa		12.42	□□□□□ -0.42
MIB2-231	ENST00000518681	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
MIB2-231	ENST00000518681	C4orf26	Q17RF5	130 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MIB2-231	ENST00000518681	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		12.41	□□□□□ -0.42

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