RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEX43Q6ZNM6 134 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q6ZRX8 168 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00299Q6ZSB3 139 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 MCFD2Q8NI22 146 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 STOML3Q8TAV4 291 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCGB1C1Q8TD33 95 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNBD2Q96M20 576 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPANXA1Q9NS26 97 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNFSF18Q9UNG2 199 aa0.73□□□□□ -2.29
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP6V1G1O75348 118 aa0.72□□□□□ -2.29
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SEC11AP67812 179 aa0.72□□□□□ -2.29
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RNU6-548P-201ENST00000517083 C5orf47Q569G3 176 aa0.72□□□□□ -2.29
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RNU6-548P-201ENST00000517083 STAG3L3P0CL85 134 aa0.7□□□□□ -2.3
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RNU6-548P-201ENST00000517083 LYRM7Q5U5X0 104 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 CST9LP1Q5W188 147 aa0.7□□□□□ -2.3
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RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00158P58513 81 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDZD11Q5EBL8 140 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 S100A7L2Q5SY68 101 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 CSAG1Q6PB30 78 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 ENKURQ8TC29 256 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIGMAR1Q99720 223 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCEAL7Q9BRU2 100 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM2Q9BVW6 85 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 CST9LQ9H4G1 147 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-548P-201ENST00000517083 SS18L2Q9UHA2 77 aa0.69□□□□□ -2.3
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