RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRF-211ENST00000467464 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM223A0PJW6 202 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRF-211ENST00000467464 SFTA2Q6UW10 78 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRF-211ENST00000467464 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRF-211ENST00000467464 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 NDUFA5Q16718 116 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00310P59036 64 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 ATP6V1G1O75348 118 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00158P58513 81 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 A0A0U1RRA0 63 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 SMIM13P0DJ93 91 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 SPRR1AP35321 89 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRF-211ENST00000467464 MUC17Q685J3 4493 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 HSBP1O75506 76 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 TRGC2P03986 189 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 SPRR4Q96PI1 79 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 PRYO14603 147 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 NCR3O14931 201 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 SERF1AO75920 110 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 HERV-K104P63124 156 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 CTAG1AP78358 180 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 TPRXLQ17RH7 258 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 H0Y8G0 127 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 LEPROTL1O95214 131 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 LEPROTO15243 131 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 S100A1P23297 94 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 DAND5Q8N907 189 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00587B1AMM8 73 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 PLNP26678 52 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 COLCA2A8K830 154 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 B5MCH6 92 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 J3QQQ9 107 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00483Q53H64 154 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 ERC2-IT1O76042 136 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 DPM2O94777 84 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 FABP4P15090 132 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 Q8NBF4 154 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 Q9BRP9 147 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 DDTP30046 118 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 NMUP48645 174 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 IGLV6-57P01721 117 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 IGKCP01834 107 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRF-211ENST00000467464 NDUFC2O95298 119 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 HERVK_113P61574 105 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 Q6ZRX8 168 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 CDIP1Q9H305 208 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 A0A0J9YXY3 114 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 A0A0U1RQV1 116 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 E9PLD3 99 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 LITAFQ99732 161 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 MOBPQ13875 183 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 HIST1H2BKO60814 126 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 SPINK1P00995 79 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 HIST1H2BJP06899 126 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRF-211ENST00000467464 HIST1H2BOP23527 126 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms