RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 PDE6DO43924 150 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 AMELXQ99217 191 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 CKS2P33552 79 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 IFITM3Q01628 133 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 C1orf195Q5TG92 126 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 OCC1Q8TAD7 63 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 SPRR2EP22531 72 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 SPRR2BP35325 72 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 SPRR2AP35326 72 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 UMAD1C9J7I0 102 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 Q75L30 129 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 H7C2G1 150 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 RIGQ13278 110 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 CT83Q5H943 113 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 B5MCH6 92 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 Q6ZVH6 145 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 ERG28Q9UKR5 140 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 S100A12P80511 92 aa6.47□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 CD164Q04900 197 aa6.47□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 COX17Q14061 63 aa6.47□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 Q5BKY6 102 aa6.47□□□□□ -1.37
C9orf3-211ENST00000463372 Q5XG85 94 aa6.46□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM29Q86T20 159 aa6.46□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 Q9BRP9 147 aa6.46□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.46□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 NPYP01303 97 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 SVIPQ8NHG7 77 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 D6R8Y8 96 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 SPINK8P0C7L1 97 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 A6NJY4 79 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 Q1RN00 199 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 Q6ZRX8 168 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 BATF3Q9NR55 127 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 NCR3O14931 201 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.4□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 IGIPA6NJ69 53 aa6.4□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 TEX46H3BTG2 121 aa6.4□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
C9orf3-211ENST00000463372 A0A0G2JQZ4 141 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 PCP2Q8IVA1 136 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.39□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 A8MWP4 228 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.37□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 HMSDA8MTL9 139 aa6.37□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 PPBPP02775 128 aa6.37□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.37□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.37□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.37□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 ARPC5O15511 151 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 PRO1933Q9H354 126 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00158P58513 81 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.34□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 C5orf52A6NGY3 159 aa6.34□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 H3BRM9 83 aa6.34□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.34□□□□□ -1.39
C9orf3-211ENST00000463372 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 ORMDL3Q8N138 153 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1B0GW15 77 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 F8W036 122 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 TCL1BO95988 128 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 SPRR2DP22532 72 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 RGS21Q2M5E4 152 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 PRELID3AQ96N28 172 aa6.32□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 SMLR1H3BR10 107 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 PMVKQ15126 192 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 OSTCQ9NRP0 149 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 A0A0U1RRA0 63 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 SPRR1BP22528 89 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 Q96NJ1 140 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 ATP6V1G1O75348 118 aa6.29□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 AKR1D1P51857 326 aa6.29□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 SFTA2Q6UW10 78 aa6.29□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.29□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms