RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295083.7

PQLC3-201, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PQLC3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-201ENST00000295083 TIMM17BO60830 172 aa15.61■□□□□ 0.09
PQLC3-201ENST00000295083 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PQLC3-201ENST00000295083 RYR1P21817 5038 aa15.6■□□□□ 0.09
PQLC3-201ENST00000295083 DLEU1O43261 78 aa15.59■□□□□ 0.09
PQLC3-201ENST00000295083 NPC2P61916 151 aa15.59■□□□□ 0.09
PQLC3-201ENST00000295083 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa15.59■□□□□ 0.09
PQLC3-201ENST00000295083 PLAC8Q9NZF1 115 aa15.59■□□□□ 0.09
PQLC3-201ENST00000295083 SLC25A34Q6PIV7 304 aa15.58■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 Q8NDZ9 215 aa15.58■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa15.57■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 FAT1Q14517 4588 aa15.56■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 TMEM238C9JI98 176 aa15.55■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 EPM2AB3EWF7 344 aa15.54■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 CDK2AP2O75956 126 aa15.54■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 C12orf57Q99622 126 aa15.54■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa15.52■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 ARL17AQ8IVW1 177 aa15.52■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 LINC00308Q8TCZ7 52 aa15.52■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 SPANXDQ9BXN6 97 aa15.52■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 SPANXCQ9NY87 97 aa15.52■□□□□ 0.08
PQLC3-201ENST00000295083 C2orf91Q6ZV80 131 aa15.52■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa15.52■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 VPREB1P12018 145 aa15.5■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 PRR3P79522 188 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 MIEN1Q9BRT3 115 aa15.5■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 PRO1933Q9H354 126 aa15.5■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 C22orf24Q9Y442 160 aa15.49■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 M0QXV9 152 aa15.48■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa15.48■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 Q6ZVH6 145 aa15.47■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 MUSTN1Q8IVN3 82 aa15.47■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 LINC00518Q8N0U6 118 aa15.47■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 RPL24P83731 157 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 HIGD1BQ9P298 99 aa15.46■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 UQCR10Q9UDW1 63 aa15.46■□□□□ 0.07
PQLC3-201ENST00000295083 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa15.45■□□□□ 0.06
PQLC3-201ENST00000295083 NKAPP1Q8N9T2 125 aa15.44■□□□□ 0.06
PQLC3-201ENST00000295083 GAGE10A6NGK3 116 aa15.43■□□□□ 0.06
PQLC3-201ENST00000295083 IFITM1P13164 125 aa15.43■□□□□ 0.06
PQLC3-201ENST00000295083 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PQLC3-201ENST00000295083 HIST1H4GQ99525 98 aa15.43■□□□□ 0.06
PQLC3-201ENST00000295083 NCR3O14931 201 aa15.41■□□□□ 0.06
PQLC3-201ENST00000295083 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa15.41■□□□□ 0.06
PQLC3-201ENST00000295083 C7orf33Q8WU49 177 aa15.41■□□□□ 0.06
PQLC3-201ENST00000295083 LINC00167Q96N53 147 aa15.4■□□□□ 0.06
PQLC3-201ENST00000295083 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa15.4■□□□□ 0.06
PQLC3-201ENST00000295083 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PQLC3-201ENST00000295083 NDUFC2O95298 119 aa15.39■□□□□ 0.05
PQLC3-201ENST00000295083 RPL37AP8A6NKH3 93 aa15.38■□□□□ 0.05
PQLC3-201ENST00000295083 COPS9Q8WXC6 57 aa15.38■□□□□ 0.05
PQLC3-201ENST00000295083 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa15.37■□□□□ 0.05
PQLC3-201ENST00000295083 IGKV2D-28P01615 120 aa15.37■□□□□ 0.05
PQLC3-201ENST00000295083 PPDPFQ9H3Y8 114 aa15.37■□□□□ 0.05
PQLC3-201ENST00000295083 M0R378 163 aa15.36■□□□□ 0.05
PQLC3-201ENST00000295083 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PQLC3-201ENST00000295083 LINC00528Q8N1L1 170 aa15.36■□□□□ 0.05
PQLC3-201ENST00000295083 UBE2BP63146 152 aa15.34■□□□□ 0.05
PQLC3-201ENST00000295083 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
PQLC3-201ENST00000295083 A4D1N5 150 aa15.33■□□□□ 0.04
PQLC3-201ENST00000295083 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa15.32■□□□□ 0.04
PQLC3-201ENST00000295083 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa15.31■□□□□ 0.04
PQLC3-201ENST00000295083 TSTD3H0UI37 97 aa15.31■□□□□ 0.04
PQLC3-201ENST00000295083 HERC2O95714 4834 aa15.31■□□□□ 0.04
PQLC3-201ENST00000295083 TAL2Q16559 108 aa15.31■□□□□ 0.04
PQLC3-201ENST00000295083 LINC00337Q8N6G1 96 aa15.31■□□□□ 0.04
PQLC3-201ENST00000295083 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa15.3■□□□□ 0.04
PQLC3-201ENST00000295083 CEND1Q8N111 149 aa15.3■□□□□ 0.04
PQLC3-201ENST00000295083 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa15.3■□□□□ 0.04
PQLC3-201ENST00000295083 HSD52Q0P140 79 aa15.28■□□□□ 0.04
PQLC3-201ENST00000295083 IGLV6-57P01721 117 aa15.27■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 DDTP30046 118 aa15.27■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 FXYD2P54710 66 aa15.26■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 S100A7L2Q5SY68 101 aa15.26■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 Q8N1X5 172 aa15.25■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 OR13C6PQ8NH95 151 aa15.25■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 FAM229AH3BQW9 127 aa15.24■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 CTAG1AP78358 180 aa15.24■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 Q5VSD8 79 aa15.24■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 A6NDN8 102 aa15.22■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 C1orf137Q5JT78 98 aa15.22■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 KCNQ1DNQ9H478 68 aa15.22■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 TMEM126AQ9H061 195 aa15.21■□□□□ 0.03
PQLC3-201ENST00000295083 CFC1BP0CG36 223 aa15.2■□□□□ 0.02
PQLC3-201ENST00000295083 CFC1P0CG37 223 aa15.2■□□□□ 0.02
PQLC3-201ENST00000295083 REG3GQ6UW15 175 aa15.19■□□□□ 0.02
PQLC3-201ENST00000295083 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa15.17■□□□□ 0.02
PQLC3-201ENST00000295083 PRYO14603 147 aa15.16■□□□□ 0.02
PQLC3-201ENST00000295083 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa15.16■□□□□ 0.02
PQLC3-201ENST00000295083 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa15.15■□□□□ 0.02
PQLC3-201ENST00000295083 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa15.15■□□□□ 0.02
PQLC3-201ENST00000295083 A6NJY4 79 aa15.15■□□□□ 0.02
PQLC3-201ENST00000295083 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PQLC3-201ENST00000295083 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms