RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598968.5

TIMM44-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, human

TSL 3

Gene TIMM44, Length 797 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM44-208	ENST00000598968	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		14.23	□□□□□ -0.13
TIMM44-208	ENST00000598968	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		14.22	□□□□□ -0.13
TIMM44-208	ENST00000598968	COLCA2	A8K830	154 aa		14.21	□□□□□ -0.13
TIMM44-208	ENST00000598968	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		14.21	□□□□□ -0.13
TIMM44-208	ENST00000598968	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968	GAGE2E	Q4V326	116 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968		Q6ZRP5	223 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		14.2	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968		H3BRM9	83 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968	HSBP1	O75506	76 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968	SPINK8	P0C7L1	97 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968	IGLC3	P0DOY3	106 aa		14.19	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968		A0A1W2PNN7	141 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968	COX7B2	Q8TF08	81 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968	SCO1	O75880	301 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968	CXCL5	P42830	114 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968		F8VRH5	84 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TIMM44-208	ENST00000598968	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968	SERF1A	O75920	110 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968	FAM168B	A1KXE4	195 aa		14.11	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		14.11	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968	C11orf86	A6NJI1	115 aa		14.1	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	14.1	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	14.1	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		14.1	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968		J3QL48	77 aa		14.09	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	14.09	□□□□□ -0.15
TIMM44-208	ENST00000598968	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		14.08	□□□□□ -0.16
TIMM44-208	ENST00000598968	LINC00310	P59036	64 aa		14.07	□□□□□ -0.16
TIMM44-208	ENST00000598968	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	14.07	□□□□□ -0.16
TIMM44-208	ENST00000598968	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		14.06	□□□□□ -0.16
TIMM44-208	ENST00000598968	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	14.06	□□□□□ -0.16
TIMM44-208	ENST00000598968	LEPROTL1	O95214	131 aa		14.06	□□□□□ -0.16
TIMM44-208	ENST00000598968		H0Y8G0	127 aa		14.05	□□□□□ -0.16
TIMM44-208	ENST00000598968	NUPR1	O60356	82 aa		14.05	□□□□□ -0.16
TIMM44-208	ENST00000598968	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		14.04	□□□□□ -0.16
TIMM44-208	ENST00000598968	FABP4	P15090	132 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TIMM44-208	ENST00000598968		M0QXV9	152 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	OXT	P01178	125 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		14	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	TMEM223	A0PJW6	202 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	PFN2	P35080	140 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	UBE2B	P63146	152 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	HIST1H2BK	O60814	126 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	HIST1H2BO	P23527	126 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	HIST1H2BB	P33778	126 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	HIST1H2BD	P58876	126 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	HIST1H2BC	P62807	126 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	ODF1	Q14990	250 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	C1orf137	Q5JT78	98 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TIMM44-208	ENST00000598968	SFTA2	Q6UW10	78 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TIMM44-208	ENST00000598968	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TIMM44-208	ENST00000598968	ERG28	Q9UKR5	140 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TIMM44-208	ENST00000598968	C22orf24	Q9Y442	160 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TIMM44-208	ENST00000598968	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	13.92	□□□□□ -0.18
TIMM44-208	ENST00000598968	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TIMM44-208	ENST00000598968	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TIMM44-208	ENST00000598968	PLN	P26678	52 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TIMM44-208	ENST00000598968	COX17	Q14061	63 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TIMM44-208	ENST00000598968	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TIMM44-208	ENST00000598968	DPM2	O94777	84 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	IGLV7-43	P04211	117 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	S100A1	P23297	94 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	LINC00158	P58513	81 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	REG3G	Q6UW15	175 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	IGKC	P01834	107 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	MYCBP2	O75592	4640 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968		A0A0U1RRA0	63 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	HERVK_113	P61574	105 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.19
TIMM44-208	ENST00000598968	LEPROT	O15243	131 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	ATP6V1G1	O75348	118 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	HERV-K104	P63124	156 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TIMM44-208	ENST00000598968	LINC00167	Q96N53	147 aa		13.83	□□□□□ -0.2

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