RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf82Q6UX34 121 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 STPG4Q8N801 248 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 F8WDY8 70 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 HSBP1O75506 76 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP5LO75964 103 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 CKS1BP61024 79 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF151Q2KHN1 245 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 NUPR1O60356 82 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 SERF1AO75920 110 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 SPINK8P0C7L1 97 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 PTTG1IPP53801 180 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 HSPG2P98160 4391 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLC3P0DOY3 106 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 FABP4P15090 132 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE2EQ4V326 116 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 Q8IZM0 81 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 COX7B2Q8TF08 81 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PNN7 141 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 H0Y8G0 127 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 H3BRM9 83 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00310P59036 64 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZRP5 223 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-211ENST00000588374 C11orf86A6NJI1 115 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 F8VRH5 84 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 LEPROTL1O95214 131 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 C7orf33Q8WU49 177 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HERC2O95714 4834 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM168BA1KXE4 195 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST1H2BKO60814 126 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST1H2BJP06899 126 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST1H2BOP23527 126 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST1H2BBP33778 126 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST1H2BDP58876 126 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST1H2BCP62807 126 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 CXCL5P42830 114 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 RYR1P21817 5038 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM223A0PJW6 202 aa4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 PFN2P35080 140 aa4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 ODF1Q14990 250 aa4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE4AQ5TA78 99 aa4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.23□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.23□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.23□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 DPM2O94777 84 aa4.22□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.22□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.22□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 C22orf24Q9Y442 160 aa4.22□□□□□ -1.73
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0U1RRA0 63 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 M0QXV9 152 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKCP01834 107 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 AKR1D1P51857 326 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00158P58513 81 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2BP63146 152 aa4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms