RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 Q8IYB0 196 aa2.47□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 SERP2Q8N6R1 65 aa2.47□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 TSKUQ8WUA8 353 aa2.47□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.47□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 CCKP06307 115 aa2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 CCL4P13236 92 aa2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 MIFP14174 115 aa2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TRGV9Q99603 122 aa2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 MGST2Q99735 147 aa2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC50A1Q9BRV3 221 aa2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00474Q9P2X8 69 aa2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 HILPDAQ9Y5L2 63 aa2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 LHFPL6Q9Y693 200 aa2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 DOCK11Q5JSL3 2073 aa2.46□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.45□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.45□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 MXRA5Q9NR99 2828 aa2.45□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 PKDREJQ9NTG1 2253 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 NOTCH1P46531 2555 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0G2JQZ4 141 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SDHAF1A6NFY7 115 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 C2orf70A6NJV1 201 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 F2Z2F3 143 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 PIPP12273 146 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 ROMO1P60602 79 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 PCBD1P61457 104 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 BLCAPP62952 87 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 LYPD5Q6UWN5 251 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 BAGE3Q86Y29 109 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 BAGE2Q86Y30 109 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SMIM4Q8WVI0 70 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SMR3AQ99954 134 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SACSQ9NZJ4 4579 aa2.43□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 P0C880 135 aa2.43□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 CXCL8P10145 99 aa2.43□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB121Q5J5C9 76 aa2.43□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 C12orf73Q69YU5 71 aa2.43□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 RYR1P21817 5038 aa2.43□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 RP1P56715 2156 aa2.43□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 H7BZZ5 65 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 FXYD1O00168 92 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV1-17P01599 117 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLV1-51P01701 117 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 RHOHQ15669 191 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 Q1T7F1 81 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 HCP5Q6MZN7 132 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 Q8N814 137 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 CCL4L1Q8NHW4 92 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SPTSSAQ969W0 71 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 U3KQA8 63 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 hDV103S1A0JD37 113 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 CRPP02741 224 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 ACYP1P07311 99 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2D3P61077 147 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2D2P62837 147 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF56Q15929 161 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TPRXLQ17RH7 258 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00643Q86TS7 51 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 NABP2Q9BQ15 211 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 NMES1Q9C002 83 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TLN2Q9Y4G6 2542 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 B4DSR2 109 aa2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 GCHFRP30047 84 aa2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 CKS2P33552 79 aa2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf134Q5TEV5 83 aa2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms