RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436789.5

LRRC23-208, Transcript of leucine rich repeat containing 23, human

TSL 3 BASIC

Gene LRRC23, Length 796 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC23-208	ENST00000436789	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.26	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HBD	P02042	147 aa		4.26	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.26	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.26	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	STPG4	Q8N801	248 aa		4.26	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.26	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.26	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789		A0A096LNJ9	63 aa		4.25	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.25	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	COX7A2L	O14548	114 aa		4.25	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	UBE2D1	P51668	147 aa		4.25	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.25	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.25	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.25	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.25	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.25	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HSBP1	O75506	76 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	ATP5L	O75964	103 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	APOM	O95445	188 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	MAL	P21145	153 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	SEC11A	P67812	179 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	COX6A2	Q02221	97 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789		A0A087WZ39	114 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	PMVK	Q15126	192 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789		F8WDY8	70 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	SERF1A	O75920	110 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	SLPI	P03973	132 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HERVK_113	P63121	156 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LRRC23-208	ENST00000436789	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	NUPR1	O60356	82 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	NDUFA6	P56556	154 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	PANO1	I0J062	215 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.19	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.19	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.19	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.19	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.19	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789		F8VRH5	84 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789		H3BRM9	83 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	NDUFA1	O15239	70 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.18	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	MUC2	Q02817	5179 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789		A0A096LNI7	61 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	PRSS2	P07478	247 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	FABP4	P15090	132 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LRRC23-208	ENST00000436789	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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