RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 FN1P02751 2386 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 PMAIP1Q13794 54 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 CYSRT1A8MQ03 144 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 Q8N814 137 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 Q8IZM0 81 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 C7orf33Q8WU49 177 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 POLQO75417 2590 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 LINC00208Q96KT6 92 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 RPL28P46779 137 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 COX17Q14061 63 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRU-204ENST00000428026 RETNQ9HD89 108 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 PSPHP1O15172 72 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 CHCHD7Q9BUK0 85 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 Q8N3U1 123 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 LELP1Q5T871 98 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 IGLV1-40P01703 118 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 OXLD1Q5BKU9 147 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 MTORP42345 2549 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 PRYO14603 147 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 CDIP1Q9H305 208 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 TRAV10A0A0B4J240 114 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 M0R2N4 97 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 PLAC8L1A1L4L8 177 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 COL4A2P08572 1712 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 C1orf137Q5JT78 98 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 LINC00846Q9NV44 126 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRU-204ENST00000428026 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 AMELXQ99217 191 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 BEAN1Q3B7T3 259 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 A8MTW9 85 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 ESRGQ1W209 222 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 LINC00575Q6W349 94 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 ODF3L2Q3SX64 289 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 PCOTHQ58A44 107 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 ACANP16112 2415 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 Q6ZSN1 163 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 PRO0628Q9UI54 55 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 DEFB116Q30KQ4 102 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 Q6ZVQ6 151 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 C10orf25Q5T742 122 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 C6orf223Q8N319 242 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa10.33□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 MUC7Q8TAX7 377 aa10.33□□□□□ -0.75
PTPRU-204ENST00000428026 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM254Q8TBM7 123 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 ADAMTS20P59510 1910 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 COX8CQ7Z4L0 72 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 LINC00337Q8N6G1 96 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 CHD7Q9P2D1 2997 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 LINC00474Q9P2X8 69 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 FHL2Q14192 279 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 A0A087WSZ3 146 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRU-204ENST00000428026 REG3GQ6UW15 175 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 Q9UF83 564 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 HECTD1Q9ULT8 2610 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 H0Y9P7 68 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 LY6G6CO95867 125 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 CRYGAP11844 174 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 HTTP42858 3142 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 C4orf26Q17RF5 130 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 X6R8D5 127 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 PTPRBP23467 1997 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 SPINK1P00995 79 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 VPREB1P12018 145 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 C5orf42Q9H799 3197 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 Q8N2B8 174 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 AGRNO00468 2067 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 C16orf95Q9H693 158 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 Q9BRP9 147 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 EXPH5Q8NEV8 1989 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 PRO0461Q9UI25 63 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 F8P00451 2351 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRU-204ENST00000428026 HCG22E2RYF7 251 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRU-204ENST00000428026 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRU-204ENST00000428026 BRI3O95415 125 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRU-204ENST00000428026 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRU-204ENST00000428026 RPS28P62857 69 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms