RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 Q8NBF4 154 aa4.96□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV6-57P01721 117 aa4.95□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.95□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.95□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 Q6ZQT0 140 aa4.95□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.95□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 ESRGQ1W209 222 aa4.95□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 LITAFQ99732 161 aa4.94□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 INAFM1C9JVW0 142 aa4.94□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 GAS8-AS1O95177 125 aa4.94□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 A0A087WYN8 130 aa4.94□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 Q8N3U1 123 aa4.94□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 PRO0628Q9UI54 55 aa4.94□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 RTTNQ86VV8 2226 aa4.94□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.94□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00694P0DN24 101 aa4.93□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC179H3BU77 68 aa4.93□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 PRR34Q9NV39 138 aa4.93□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.93□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.93□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.93□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.93□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 C16orf90A8MZG2 172 aa4.92□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 Q6ZRX8 168 aa4.92□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 X6R8D5 127 aa4.92□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 SLPIP03973 132 aa4.92□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 Q9BRP9 147 aa4.92□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.91□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00846Q9NV44 126 aa4.91□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.91□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1W2PPR1 153 aa4.91□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 WIPF1O43516 503 aa4.91□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 PTPN13Q12923 2485 aa4.9□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 PTPRBP23467 1997 aa4.9□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 KLKP1Q107X0 134 aa4.9□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.9□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 CADP27708 2225 aa4.9□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.9□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.9□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 ACYP2P14621 99 aa4.9□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 Q6ZSN1 163 aa4.9□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 MDFIQ99750 246 aa4.9□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.9□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 H0Y9P7 68 aa4.89□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.89□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.89□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 A0A096LNT2 108 aa4.89□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 Q8NAQ8 132 aa4.89□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 POLEQ07864 2286 aa4.89□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.88□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 C22orf24Q9Y442 160 aa4.88□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.88□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 CDSNQ15517 529 aa4.88□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.88□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.88□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 Q6ZRU5 148 aa4.88□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.88□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.88□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00208Q96KT6 92 aa4.88□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 TNCP24821 2201 aa4.87□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 ICE1Q9Y2F5 2266 aa4.87□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.87□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 WNK2Q9Y3S1 2297 aa4.87□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 A6NED7 52 aa4.87□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 CD164Q04900 197 aa4.87□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa4.87□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.87□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 C3orf84H3BNL1 204 aa4.86□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 FAM229AH3BQW9 127 aa4.86□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 DEFB4AO15263 64 aa4.86□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 Q6ZTC4 211 aa4.86□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.86□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.86□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.86□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.86□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 PKDREJQ9NTG1 2253 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 A8MWP4 228 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV2D-28P01615 120 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 PLCE1Q9P212 2302 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 LRRK2Q5S007 2527 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.83□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.83□□□□□ -1.64
ALMS1-201ENST00000423048 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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