RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 CXCL6P80162 114 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 PCOTHQ58A44 107 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 PTPRSQ13332 1948 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 FHL2Q14192 279 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 Q9UF83 564 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 C19orf84I3L1E1 186 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 LINC00315P59091 139 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 LRP4O75096 1905 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 LELP1Q5T871 98 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 ZNF702PQ9H963 129 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.96□□□□□ -1.29
HERC3-202ENST00000402738 H0Y9P7 68 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 LTBP2Q14767 1821 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 SMIM29Q86T20 159 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 C6orf223Q8N319 242 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 C10orf25Q5T742 122 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 LINC01006Q8NI28 216 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 BCE1O60756 84 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 PRO3102Q9H379 93 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 ADAMTS20P59510 1910 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 HCG22E2RYF7 251 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 LIMD2Q9BT23 127 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 PTPRBP23467 1997 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 A0A087WSZ3 146 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 hDV103S1A0JD37 113 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 C14orf177Q52M58 125 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 C10orf142B7Z368 130 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HERC3-202ENST00000402738 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 LITAFQ99732 161 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZQT0 140 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 AVPP01185 164 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 VPREB1P12018 145 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 CDSNQ15517 529 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GUV1 79 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 PLA2G2AP14555 144 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 REG3GQ6UW15 175 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 CENPFP49454 3210 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 KIAA0087Q14695 138 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 Q9BRP9 147 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-202ENST00000402738 A8MUN3 132 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 J3QKU1 62 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 BRI3O95415 125 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 IGF2RP11717 2491 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 MUC4Q99102 2169 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZRU5 148 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 SPINK1P00995 79 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 UTRNP46939 3433 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 FSHBP01225 129 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 F8WDY8 70 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 IL17DQ8TAD2 202 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 H7BZZ5 65 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 KLKP1Q107X0 134 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 PRLHP81277 87 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-202ENST00000402738 IGLV1-51P01701 117 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 C2orf48Q96LS8 159 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GU69 56 aa6.77□□□□□ -1.33
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