RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 LEPROTO15243 131 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV2D-28P01615 120 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 CXCL5P42830 114 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N3U1 123 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 H7C423 109 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 M0QXV9 152 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 GHRHP01286 108 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 PYY3Q5JQD4 70 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf82Q6UX34 121 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 CNFNQ9BYD5 112 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 CHTF8P0CG12 524 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GV72 72 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 CDPF1Q6NVV7 123 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM238C9JI98 176 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 IGKCP01834 107 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 RNF185Q96GF1 192 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 DIRC1Q969H9 104 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 VAMP8Q9BV40 100 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 GAS8-AS1O95177 125 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 NCR3O14931 201 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087WYN8 130 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 NUPR1O60356 82 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00694P0DN24 101 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 F8VRH5 84 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZRP5 223 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 SFTA2Q6UW10 78 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2BLQ99880 126 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N814 137 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 Q9UF83 564 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 Q5VSD8 79 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 PAM16Q9Y3D7 125 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 ANK2Q01484 3957 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 SPINK6Q6UWN8 80 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZRU5 148 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 NRACQ8N912 160 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 CDIP1Q9H305 208 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GUV1 79 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 K7EMI3 77 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 DAND5Q8N907 189 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 PTH2Q96A98 100 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 ERG28Q9UKR5 140 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 J3QQQ9 107 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 TSHBP01222 138 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 K7ERU9 68 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 HERV-K104P63124 156 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 UPK3BQ9BT76 320 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 C3orf79P0CE67 100 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 ESDP10768 282 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00310P59036 64 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 ENHOQ6UWT2 76 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00173Q6ZV60 143 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 SCXQ7RTU7 201 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 CRYGAP11844 174 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00242Q5T6M2 205 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf48Q96LS8 159 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 PET117Q6UWS5 81 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms