RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608107.1

ITGB5-211, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-211ENST00000608107 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 TM2D2Q9BX73 214 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 RYR2Q92736 4967 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGB5-211ENST00000608107 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 C3orf79P0CE67 100 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 ODF1Q14990 250 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 COX11Q9Y6N1 276 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 IGLC3P0DOY3 106 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 S100A2P29034 98 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 KRTDAPP60985 99 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.76□□□□□ -1.33
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ITGB5-211ENST00000608107 C11orf86A6NJI1 115 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 USP17L23D6RBM5 183 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 COX7A2LO14548 114 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 C15orf56Q8N910 161 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 F8VRH5 84 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 HERVK_113P63121 156 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 A0A087WZ39 114 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 SEC11AP67812 179 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 RYR3Q15413 4870 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 SPINK8P0C7L1 97 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 MALP21145 153 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 LINC01545Q5VT33 79 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 PET117Q6UWS5 81 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB5-211ENST00000608107 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.72□□□□□ -1.33
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ITGB5-211ENST00000608107 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 DPM2O94777 84 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 Q8N814 137 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 A0A1B0GVY2 172 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 hDV102S1A0JD36 115 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 IGKCP01834 107 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 SLPIP03973 132 aa6.7□□□□□ -1.34
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ITGB5-211ENST00000608107 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM223A0PJW6 202 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 SPAG11BQ08648 103 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 KIAA0087Q14695 138 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 ATOH7Q8N100 152 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.69□□□□□ -1.34
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ITGB5-211ENST00000608107 H3BRM9 83 aa6.68□□□□□ -1.34
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ITGB5-211ENST00000608107 PLNP26678 52 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 EREGO14944 169 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 LINC01620Q4KN68 170 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 C14orf177Q52M58 125 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 C2orf82Q6UX34 121 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 STPG4Q8N801 248 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 PKD1P98161 4303 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 C20orf202A1L168 122 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 MAJINQ3KP22 176 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 C10orf25Q5T742 122 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 Q6ZRU5 148 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 COX7B2Q8TF08 81 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 SCGB1D1O95968 90 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 PRSS2P07478 247 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 Q8IZM0 81 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGB5-211ENST00000608107 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGB5-211ENST00000608107 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGB5-211ENST00000608107 SYCNQ0VAF6 134 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGB5-211ENST00000608107 LEPROTO15243 131 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGB5-211ENST00000608107 AKR1D1P51857 326 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGB5-211ENST00000608107 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ITGB5-211ENST00000608107 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGB5-211ENST00000608107 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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