RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 C20orf78Q9BR46 151 aa6.71□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 A0A1B0GW15 77 aa6.7□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.7□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 SMKR1H3BMG3 65 aa6.7□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 S100A8P05109 93 aa6.7□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 RNF151Q2KHN1 245 aa6.7□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 C5orf38Q86SI9 138 aa6.7□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 NRACQ8N912 160 aa6.7□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.7□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 IMMP2LQ96T52 175 aa6.7□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 CKS2P33552 79 aa6.69□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 C1orf137Q5JT78 98 aa6.69□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.69□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 Q6ZUT4 128 aa6.69□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.69□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.68□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 F8W036 122 aa6.68□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 NDUFA1O15239 70 aa6.68□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 IGLV7-43P04211 117 aa6.68□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.68□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.67□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 H0Y9J4 135 aa6.67□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 HBBP68871 147 aa6.67□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.67□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 DIRC1Q969H9 104 aa6.67□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.66□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 PPBPP02775 128 aa6.66□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.66□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 A0A1B0GXF2 115 aa6.65□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 IFITM10A6NMD0 228 aa6.65□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 TNFRSF6BO95407 300 aa6.65□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 RAB5AP20339 215 aa6.65□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNF4-218ENST00000513284 A0A087WZ39 114 aa6.64□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.64□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.63□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 D6R8Y8 96 aa6.63□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 TSPAN13O95857 204 aa6.63□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 UBE2BP63146 152 aa6.62□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 ORMDL3Q8N138 153 aa6.62□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 FAM104AQ969W3 186 aa6.62□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.62□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.61□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 NPYP01303 97 aa6.61□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 GAGE2EQ4V326 116 aa6.61□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 Q6ZN92 141 aa6.61□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.61□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.61□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 UBE2D1P51668 147 aa6.6□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 RAB14P61106 215 aa6.6□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.6□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.6□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.6□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.6□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.6□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.6□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.6□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 M0QXV9 152 aa6.59□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 PRSS2P07478 247 aa6.59□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.59□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.59□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 TMEM141Q96I45 108 aa6.59□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 PRELID3AQ96N28 172 aa6.59□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.59□□□□□ -1.35
RNF4-218ENST00000513284 PRSS47A8MTI9 375 aa6.58□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.58□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 MT-ND4LP03901 98 aa6.58□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 CLLU1Q5K131 121 aa6.58□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.58□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.58□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.57□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 FAM168BA1KXE4 195 aa6.57□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.57□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 C10orf25Q5T742 122 aa6.57□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.57□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 K7EMI3 77 aa6.56□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 NPSP0C0P6 89 aa6.56□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 G0S2P27469 103 aa6.56□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 CKS1BP61024 79 aa6.56□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 SEC11AP67812 179 aa6.56□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.56□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.56□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 NUPR1O60356 82 aa6.55□□□□□ -1.36
RNF4-218ENST00000513284 IFITM2Q01629 132 aa6.55□□□□□ -1.36
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