RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513274.5

COPB2-211, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 3

Gene COPB2, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-211ENST00000513274 MT-ND4LP03901 98 aa7.03□□□□□ -1.28
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COPB2-211ENST00000513274 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
COPB2-211ENST00000513274 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.02□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 HBBP68871 147 aa7.02□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.02□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 TMEM18Q96B42 140 aa7.02□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 C2orf48Q96LS8 159 aa7.02□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
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COPB2-211ENST00000513274 C10orf25Q5T742 122 aa7□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 ANAPC16Q96DE5 110 aa7□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 A0A087WZ39 114 aa6.99□□□□□ -1.29
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COPB2-211ENST00000513274 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.99□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.99□□□□□ -1.29
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COPB2-211ENST00000513274 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.99□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.99□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 D6R8Y8 96 aa6.98□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 PPBPP02775 128 aa6.98□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 RAB5AP20339 215 aa6.98□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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COPB2-211ENST00000513274 C20orf78Q9BR46 151 aa6.98□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 IFITM10A6NMD0 228 aa6.97□□□□□ -1.29
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COPB2-211ENST00000513274 IGLV7-43P04211 117 aa6.97□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 RNF151Q2KHN1 245 aa6.97□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 UQCC3Q6UW78 93 aa6.97□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 ORMDL3Q8N138 153 aa6.97□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 IMMP2LQ96T52 175 aa6.97□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.97□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
COPB2-211ENST00000513274 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.96□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.96□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 S100PP25815 95 aa6.96□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.96□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.95□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 DIRC1Q969H9 104 aa6.95□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 PRELID3AQ96N28 172 aa6.95□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.95□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.94□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 ADCYAP1P18509 176 aa6.94□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 UBE2BP63146 152 aa6.94□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 C2orf82Q6UX34 121 aa6.94□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.94□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.94□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.93□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 H0Y9J4 135 aa6.93□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.93□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 COMMD7Q86VX2 200 aa6.93□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.93□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 A0A1B0GXF2 115 aa6.92□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 TMEM218A2RU14 115 aa6.92□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 F8WDY8 70 aa6.92□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 M0QXV9 152 aa6.92□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.92□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 KIAA0087Q14695 138 aa6.92□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.92□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.91□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 NDUFA5Q16718 116 aa6.91□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.91□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 G0S2P27469 103 aa6.9□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.9□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 Q6ZN92 141 aa6.9□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.9□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 TMEM141Q96I45 108 aa6.9□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 SEC11CQ9BY50 192 aa6.9□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.9□□□□□ -1.3
COPB2-211ENST00000513274 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.89□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.88□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.88□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.88□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.88□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 UBE2D1P51668 147 aa6.88□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 PRR4Q16378 134 aa6.88□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.88□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.88□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.88□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.88□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.88□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.87□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 PRSS2P07478 247 aa6.87□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
COPB2-211ENST00000513274 RHEBQ15382 184 aa6.86□□□□□ -1.31
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