RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 CRYGAP11844 174 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 DSCR9P59020 149 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 C2orf48Q96LS8 159 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 A0A087WVE0 104 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 MALP21145 153 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 COPS9Q8WXC6 57 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 DSCR8Q96T75 97 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 Q6YL49 198 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 WNK1Q9H4A3 2382 aa9.69□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.69□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 C22orf24Q9Y442 160 aa9.69□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 ITPR3Q14573 2671 aa9.68□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa9.68□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 FSHBP01225 129 aa9.68□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 CCDC168Q8NDH2 2452 aa9.68□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 J3QLI3 93 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 CRPP02741 224 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 DEFB131AP59861 70 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 RNF152Q8N8N0 203 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 DPH3Q96FX2 82 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.67□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 RPS28P62857 69 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 TMEM89A2RUT3 159 aa9.66□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.66□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 LINC00846Q9NV44 126 aa9.66□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 SERP2Q8N6R1 65 aa9.66□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.66□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.65□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.65□□□□□ -0.86
NISCH-212ENST00000488380 C4orf26Q17RF5 130 aa9.65□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 A0A087WYN8 130 aa9.64□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 USP17L23D6RBM5 183 aa9.64□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 TMEM258P61165 79 aa9.64□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.64□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 NCR3O14931 201 aa9.64□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 Q96MF0 132 aa9.64□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 ZNF843Q8N446 348 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 SLPIP03973 132 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 TENM4Q6N022 2769 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 LECT2O14960 151 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 LINC00158P58513 81 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 ZNF415Q09FC8 603 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.61□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.61□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.61□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 JMJD1CQ15652 2540 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 ACANP16112 2415 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-53P01767 116 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 OXTP01178 125 aa9.59□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 Q6JHZ5 121 aa9.59□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.59□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PRX2 142 aa9.58□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 PFN2P35080 140 aa9.58□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 HILS1P60008 231 aa9.58□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.58□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.58□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.58□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 PAX4O43316 350 aa9.57□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 PF4P02776 101 aa9.57□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 MTORP42345 2549 aa9.57□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.57□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 F5H768 121 aa9.57□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 IGKV2D-28P01615 120 aa9.57□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 UPK3BQ9BT76 320 aa9.57□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.56□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.56□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.56□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.56□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 UBE2L6O14933 153 aa9.55□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 GHRHP01286 108 aa9.55□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 H0YGX0 51 aa9.55□□□□□ -0.88
NISCH-212ENST00000488380 FHL2Q14192 279 aa9.55□□□□□ -0.88
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