RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 CFAP54Q96N23 3096 aa9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 EDN2P20800 178 aa9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 NRACQ8N912 160 aa9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 GAS8-AS1O95177 125 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 U3KQK5 164 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 A0A0B4J2C4 111 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 H3BQ85 93 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM223A0PJW6 202 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 C9orf85Q96MD7 179 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 A0A096LNI7 61 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 SYCNQ0VAF6 134 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 FOXI1Q12951 378 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 A8MZ25 164 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 TSHBP01222 138 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFA7O95182 113 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 TCL1BO95988 128 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 A0A087WZ39 114 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 CNFNQ9BYD5 112 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 COL6A3P12111 3177 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1B0GX51 115 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV1-51P01701 117 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 LELP1Q5T871 98 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 PDE6GP18545 87 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 B9D2Q9BPU9 175 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 C6orf99Q4VX62 202 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 B5MCH6 92 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.72□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.72□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.72□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.72□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 MP68P56378 58 aa9.71□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
HDLBP-241ENST00000487169 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 M0R2N4 97 aa9.71□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 UBE2D3P61077 147 aa9.71□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 UBE2D2P62837 147 aa9.71□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 SLPIP03973 132 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 A0A0J9YWU9 116 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 H0Y9J4 135 aa9.7□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 ATOX1O00244 68 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 TRIAP1O43715 76 aa9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.68□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 BRI3O95415 125 aa9.68□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.68□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.68□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV2D-28P01615 120 aa9.68□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.67□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 BPY2O14599 106 aa9.67□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF580Q9UK33 172 aa9.67□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 RETNQ9HD89 108 aa9.67□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 UBE2D1P51668 147 aa9.66□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00643Q86TS7 51 aa9.66□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.66□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 IGIPA6NJ69 53 aa9.66□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.65□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.65□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.65□□□□□ -0.86
HDLBP-241ENST00000487169 A0A096LNJ9 63 aa9.65□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.65□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.64□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 TIMM17BO60830 172 aa9.64□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.64□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZQY7 126 aa9.64□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 LY6G6CO95867 125 aa9.64□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 PCSK5Q92824 1860 aa9.64□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.63□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 C16orf95Q9H693 158 aa9.63□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.62□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZTC4 211 aa9.62□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM258P61165 79 aa9.62□□□□□ -0.87
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