RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411348.1

RNU6-57P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 57, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-57P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-57P-201ENST00000411348 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 C5orf38Q86SI9 138 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARL11Q969Q4 196 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 LINC00470Q9BZP3 86 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 UQCR10Q9UDW1 63 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 APLNQ9ULZ1 77 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 GRIN2AQ12879 1464 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF236Q9UL36 1845 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 LINC01600Q96MT4 127 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 LINC00474Q9P2X8 69 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 LAMA5O15230 3695 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 RYR2Q92736 4967 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 PRDM2Q13029 1718 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 NWD2Q9ULI1 1742 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 RYR1P21817 5038 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 GNG7O60262 68 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 FGF7P21781 194 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 SPRR2EP22531 72 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 MT4P47944 62 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 CATR1Q13166 79 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 CCDC58Q4VC31 144 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 PRO1933Q9H354 126 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 BICRAQ9NZM4 1560 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 NAIPQ13075 1403 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 A0A1B0GWA3 101 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 C9orf153Q5TBE3 101 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM223AQ8IWN6 122 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 TSC2P49815 1807 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 MYH8P13535 1937 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM24AA6NFZ4 105 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 F6UZH7 168 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 NDUFA2O43678 99 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 AKAIN1P0CW23 69 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 GNG11P61952 73 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 MANBALQ9NQG1 85 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 CRIPTQ9P021 101 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 DOCK1Q14185 1865 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 TACC2O95359 2948 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 OOSP1A8MZH6 123 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 I3L3M4 83 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 K7EP13 123 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 COX6CP09669 75 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRAPPC2P0DI81 140 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 SEC11AP67812 179 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 LCN9Q8WX39 176 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 CEP152O94986 1710 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 PATJQ8NI35 1801 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 UBE2D3P61077 147 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 UBE2D2P62837 147 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 C1orf54Q8WWF1 131 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 PP6455Q8WZ26 134 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 TSC22D3Q99576 134 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-57P-201ENST00000411348 C12orf57Q99622 126 aa-0.47□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms