RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
HOXD11-201ENST00000249504 NFE4Q86UQ8 179 aa13.08□□□□□ -0.31
HOXD11-201ENST00000249504 IGLC3P0DOY3 106 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 ENHOQ6UWT2 76 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 STPG4Q8N801 248 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 RTL8CO15255 209 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 CLPSL2Q6UWE3 100 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 UBE2WQ96B02 151 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 Q9HAA7 133 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 C11orf86A6NJI1 115 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 CRPP02741 224 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 CHAC1Q9BUX1 264 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 HERVK_113P61574 105 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 SEC11AP67812 179 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD39Q53RE8 183 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 MIEN1Q9BRT3 115 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 UQCR10Q9UDW1 63 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 DNAH2Q9P225 4427 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 UBE2D1P51668 147 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 DNAH10Q8IVF4 4471 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0J9YXV3 536 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 MIAQ16674 131 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 DDTP30046 118 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM170BQ5T4T1 132 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 C14orf144Q96I85 54 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD11-201ENST00000249504 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 COX8AP10176 69 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 SLC25A34Q6PIV7 304 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 PSCAO43653 123 aa13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 NMUP48645 174 aa13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 HERVK_113P63121 156 aa13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 RMI2Q96E14 147 aa13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 FRAS1Q86XX4 4008 aa13□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 E9PLD3 99 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 CCL25O15444 150 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 SS18Q15532 418 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 TM2D2Q9BX73 214 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 H3BRM9 83 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 TNP2Q05952 138 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 C1orf43Q9BWL3 253 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM223A0PJW6 202 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 DLEU1O43261 78 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00242Q5T6M2 205 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00469Q8N7U9 141 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 DNAH17Q9UFH2 4485 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 COX11Q9Y6N1 276 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXD11-201ENST00000249504 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 BOD1L2Q8IYS8 172 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 XCL1P47992 114 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 PCP2Q8IVA1 136 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 LEPROTO15243 131 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHB2Q96CS7 222 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 COX6A2Q02221 97 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 FOXI1Q12951 378 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 FAT2Q9NYQ8 4349 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00587B1AMM8 73 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 EREGO14944 169 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 J3QQQ9 107 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 A0A087WTM6 91 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 SPINK8P0C7L1 97 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1B0GVY2 172 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 C5orf38Q86SI9 138 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF815PA8K554 130 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 COX7A2LO14548 114 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 CTAG1AP78358 180 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 TTTY13Q9BZ97 58 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 A0A087WZ39 114 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 HIGD1BQ9P298 99 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 LRCOL1A6NCL2 159 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 LECT2O14960 151 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 C2orf91Q6ZV80 131 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM1B2RUZ4 78 aa12.83□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 TSPEAR-AS2P59090 65 aa12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms