RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 TMUB2Q71RG4 321 aa3.96□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa3.96□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 DIRC1Q969H9 104 aa3.96□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.95□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 SMLR1H3BR10 107 aa3.95□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 BCL2L11O43521 198 aa3.95□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 PET100P0DJ07 73 aa3.95□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 ESDP10768 282 aa3.95□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 RPL35P42766 123 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.95□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 C5orf38Q86SI9 138 aa3.95□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.95□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 STOML3Q8TAV4 291 aa3.95□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.95□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.95□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa3.94□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 APOMO95445 188 aa3.94□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 CENPWQ5EE01 88 aa3.94□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa3.94□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM242Q9NWH2 141 aa3.94□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.93□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 SS18Q15532 418 aa3.93□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 LCE4AQ5TA78 99 aa3.93□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.93□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.93□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 SFT2D1Q8WV19 159 aa3.93□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.93□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.93□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.92□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 K7EN84 100 aa3.92□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 CTRLP40313 264 aa3.92□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.92□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa3.92□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.92□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.92□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM213BQ8TBF2 198 aa3.92□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 MBD3L1Q8WWY6 194 aa3.92□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 NUDT11Q96G61 164 aa3.92□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 SMKR1H3BMG3 65 aa3.91□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 APCSP02743 223 aa3.91□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 TWIST1Q15672 202 aa3.91□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 GAGE2EQ4V326 116 aa3.91□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 Q6ZUT4 128 aa3.91□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 C9orf62Q8N4C0 152 aa3.91□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 MED28Q9H204 178 aa3.91□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.91□□□□□ -1.78
CTDSP2-208ENST00000552294 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.9□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 COX7A2LO14548 114 aa3.9□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 UBE2D1P51668 147 aa3.9□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 SPAG11BQ08648 103 aa3.9□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 RNF151Q2KHN1 245 aa3.9□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 C2orf82Q6UX34 121 aa3.9□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.9□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 C11orf52Q96A22 123 aa3.9□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 CNFNQ9BYD5 112 aa3.9□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 I3L3M4 83 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 M0QXV9 152 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 NCR2O95944 276 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 IFNA1P01562 189 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 TRGC1P0CF51 173 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 PMCHP20382 165 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 KIAA0087Q14695 138 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 C2orf48Q96LS8 159 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa3.88□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa3.88□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 H7C423 109 aa3.88□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 ARPC5O15511 151 aa3.88□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF861PO60384 105 aa3.88□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 MALP21145 153 aa3.88□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 RPL39P62891 51 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 S100ZQ8WXG8 99 aa3.88□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 SMDT1Q9H4I9 107 aa3.88□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 GNG13Q9P2W3 67 aa3.88□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.87□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 F2Z2F3 143 aa3.87□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 UBE2BP63146 152 aa3.87□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 TPRXLQ17RH7 258 aa3.87□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.87□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.87□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 OCC1Q8TAD7 63 aa3.87□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 ORAOV1Q8WV07 137 aa3.87□□□□□ -1.79
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM101Q96IK0 257 aa3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 199.4 ms