RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 FAM104AQ969W3 186 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-215ENST00000549143 CRYBA4P53673 196 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-215ENST00000549143 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-215ENST00000549143 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-215ENST00000549143 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-215ENST00000549143 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-215ENST00000549143 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.91□□□□□ -1.46
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CS-215ENST00000549143 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
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CS-215ENST00000549143 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.91□□□□□ -1.46
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CS-215ENST00000549143 Q6ZVH6 145 aa5.89□□□□□ -1.47
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CS-215ENST00000549143 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.89□□□□□ -1.47
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CS-215ENST00000549143 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.89□□□□□ -1.47
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CS-215ENST00000549143 ZNF815PA8K554 130 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 A8MZ25 164 aa5.89□□□□□ -1.47
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CS-215ENST00000549143 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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CS-215ENST00000549143 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.88□□□□□ -1.47
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CS-215ENST00000549143 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.88□□□□□ -1.47
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CS-215ENST00000549143 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.87□□□□□ -1.47
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CS-215ENST00000549143 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 K7EIL1 84 aa5.87□□□□□ -1.47
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CS-215ENST00000549143 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.87□□□□□ -1.47
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CS-215ENST00000549143 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 DLEU1O43261 78 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 HIST1H4GQ99525 98 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 PTTG1IPP53801 180 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 SIVA1O15304 175 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CS-215ENST00000549143 FXYD2P54710 66 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 RBX1P62877 108 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 HSD52Q0P140 79 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 RAB37Q96AX2 223 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.83□□□□□ -1.48
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CS-215ENST00000549143 NPSP0C0P6 89 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 XCL1P47992 114 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 A0A0U1RRA0 63 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 LEPROTO15243 131 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 HERVK_113P63121 156 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5.82□□□□□ -1.48
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