RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	SPX	Q9BT56	116 aa		11.34	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		11.33	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193		P0DMU3	169 aa		11.33	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM231A	P0DMU4	169 aa		11.33	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM231C	P0DMU5	169 aa		11.33	□□□□□ -0.59
GRSF1-208	ENST00000545193		A4D1N5	150 aa		11.33	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		11.33	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	GAGE5	Q13069	117 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	GAGE6	Q13070	117 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A0J9YXV3	536 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193		B5MCH6	92 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	TEN1	Q86WV5	123 aa		11.32	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	JMJD1C	Q15652	2540 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		11.31	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM223	A0PJW6	202 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	HERV-K104	P63124	156 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	IL17D	Q8TAD2	202 aa		11.29	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193		C9JAW5	83 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	RHOD	O00212	210 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZSN1	163 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	LEPROT	O15243	131 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	CITED1	Q99966	193 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	VCX2	Q9H322	139 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		11.27	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193		I3L3M4	83 aa		11.27	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
GRSF1-208	ENST00000545193	RS1	O15537	224 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV3-33	P01772	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193		Q1RN00	199 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	RHOH	Q15669	191 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC25A20	O43772	301 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193		Q9UF83	564 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	VWF	P04275	2813 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		11.25	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		11.25	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		11.25	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		11.25	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		11.25	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV3-53	P01767	116 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	NACA	E9PAV3	2078 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	PRSS2	P07478	247 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A0J9YXY3	114 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193		A8MZ25	164 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	NPC2	P61916	151 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZTI0	123 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	C16orf74	Q96GX8	76 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	F8	P00451	2351 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM104A	Q969W3	186 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GRSF1-208	ENST00000545193	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A0B4J2C4	111 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	ATR	Q13535	2644 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	CCDC179	H3BU77	68 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	TRIAP1	O43715	76 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	LITAF	Q99732	161 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	GAGE12J	A6NER3	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	GAGE7	O76087	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	GAGE12F	P0CL80	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	GAGE12G	P0CL81	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	GAGE12I	P0CL82	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	GAGE4	Q13068	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC01620	Q4KN68	170 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62

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