RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517728.1

IGHVII-44-2-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-44-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-44-2, Length 250 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 BTF3L4Q96K17 158 aa3.39□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ST20Q9HBF5 79 aa3.39□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 V9GYV3 84 aa3.39□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 USP17L23D6RBM5 183 aa3.38□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PPP1R2P9O14990 202 aa3.38□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 XGP55808 180 aa3.38□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.38□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.38□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.38□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NUP35Q8NFH5 326 aa3.38□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TMEM101Q96IK0 257 aa3.38□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC00862A6NCI5 91 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C9JQL5 133 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 F8W036 122 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 VCYO14598 125 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TCAPO15273 167 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FGF6P10767 208 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RAB4AP20338 218 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FCER1GP30273 86 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 Q5VSD8 79 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CFAP161Q6P656 301 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 Q6ZSA8 131 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 AMN1Q8IY45 258 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KIR2DL4Q99706 377 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.37□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TSHBP01222 138 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MT-ND4LP03901 98 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ESDP10768 282 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CAMPP49913 170 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HBBP68871 147 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM104BQ5XKR9 115 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TMEM18Q96B42 140 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RNF185Q96GF1 192 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C20orf78Q9BR46 151 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TMEM242Q9NWH2 141 aa3.36□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 hDV102S1A0JD36 115 aa3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CCL25O15444 150 aa3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PPBPP02775 128 aa3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRSS1P07477 247 aa3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CKS2P33552 79 aa3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RPS10P46783 165 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RPL32P62910 135 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SS18Q15532 418 aa3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CLLU1Q5K131 121 aa3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NRACQ8N912 160 aa3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.35□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 A0A1B0GXF2 115 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SMKR1H3BMG3 65 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PHOX2AO14813 284 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GAS8-AS1O95177 125 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HAMPP81172 84 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC01620Q4KN68 170 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 UQCC3Q6UW78 93 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SCXQ7RTU7 201 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ORMDL3Q8N138 153 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAT1Q14517 4588 aa3.34□□□□□ -1.88
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C1orf196B1AJZ1 125 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 D6R8Y8 96 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRYO14603 147 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RAB5AP20339 215 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 XCL1P47992 114 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SMIM2Q9BVW6 85 aa3.33□□□□□ -1.88
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms