RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SYCN	Q0VAF6	134 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf137	Q5JT78	98 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GV50	99 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF6B	O95407	300 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	IFITM3	Q01628	133 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ISOC2	Q96AB3	205 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	BTF3L4	Q96K17	158 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL25	O15444	150 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	APCS	P02743	223 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	DIRC1	Q969H9	104 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM101	Q96IK0	257 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	MED28	Q9H204	178 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ALG5	Q9Y673	324 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	XKRY2	A2RUG3	117 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF6	P10767	208 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TMUB2	Q71RG4	321 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PNN7	141 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511		F2Z2F3	143 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511		H7C423	109 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLC6	P0CF74	106 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL2	P10415	239 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	NTF3	P20783	257 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMP	P49913	170 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2D1	P51668	147 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	SS18	Q15532	418 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	NCR2	O95944	276 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNA1	P01562	189 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511		Q5BKY6	102 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WZ39	114 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	APOM	O95445	188 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV7-43	P04211	117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	PMCH	P20382	165 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPW	Q5EE01	88 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	GATD1	Q8NB37	220 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511		H0Y9J4	135 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	TSKU	Q8WUA8	353 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	ARPC5	O15511	151 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	GNG4	P50150	75 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	MRAP2	Q96G30	205 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511		I3L3M4	83 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	COX7A2L	O14548	114 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP35	Q8NFH5	326 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	UMAD1	C9J7I0	102 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL2L11	O43521	198 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX261	Q6UWH6	196 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	BIN3	Q9NQY0	253 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	GNG13	Q9P2W3	67 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB19	A4D1S5	217 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN13	O95857	204 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2B	P63146	152 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf48	Q96LS8	159 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	CTRL	P40313	264 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL20	P78556	96 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	SPAG11B	Q08648	103 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf52	Q96A22	123 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM12	Q96EX1	92 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		6.48	□□□□□ -1.37

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