RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM210AQ96ND0 272 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A087WZ39 114 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 IFNA1P01562 189 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 ESDP10768 282 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CENPWQ5EE01 88 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TEX261Q6UWH6 196 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 I3L3M4 83 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 COX7A2LO14548 114 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 BCL2L11O43521 198 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 MALP21145 153 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 MUC17Q685J3 4493 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TWIST1Q15672 202 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 MRAP2Q96G30 205 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 UMAD1C9J7I0 102 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 G3V3Q6 166 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A1B0GV50 99 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 PMCHP20382 165 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 BIN3Q9NQY0 253 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 TSHBP01222 138 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 GNG4P50150 75 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 CCL20P78556 96 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 MANBALQ9NQG1 85 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 F8WDY8 70 aa8.44□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.44□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 SPAG11BQ08648 103 aa8.44□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.44□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 IMMP2LQ96T52 175 aa8.44□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM168BA1KXE4 195 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 RAB19A4D1S5 217 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 ARPC5O15511 151 aa8.42□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 TSPAN13O95857 204 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 NUDT11Q96G61 164 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 ST20Q9HBF5 79 aa8.41□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 M0QXV9 152 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 UBE2BP63146 152 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 C5orf38Q86SI9 138 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 GNG13Q9P2W3 67 aa8.4□□□□□ -1.06
PRPF40A-211ENST00000493468 NDUFA1O15239 70 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 PDE6DO43924 150 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF861PO60384 105 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF345Q14585 488 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 TPRXLQ17RH7 258 aa8.37□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 C10orf25Q5T742 122 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 MED9Q9NWA0 146 aa8.35□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A087X002 238 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 NUPR1O60356 82 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 GAGE2EQ4V326 116 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 Q6ZUT4 128 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 CDIP1Q9H305 208 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.34□□□□□ -1.07
PRPF40A-211ENST00000493468 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 FCER1GP30273 86 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 TEX46H3BTG2 121 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 K7EN84 100 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 VCYO14598 125 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 CRYGAP11844 174 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.31□□□□□ -1.08
PRPF40A-211ENST00000493468 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.6 ms