RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 RAB5BP61020 215 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 BAALCQ8WXS3 180 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 TM2D2Q9BX73 214 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 Q0VG73 95 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 PMCHP20382 165 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 LINC00310P59036 64 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZSA8 131 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 Q8N8P6 123 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 I3L3M4 83 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 VCYO14598 125 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 KLK12Q9UKR0 248 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 LINC01546A6NGU7 62 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 TSHBP01222 138 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 NDUFA6P56556 154 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 NIT1Q86X76 327 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 BAGE3Q86Y29 109 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 TCAPO15273 167 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 NUPR1O60356 82 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 SERF1AO75920 110 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 FA2HQ7L5A8 372 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PRAME-212ENST00000485532 J3QL48 77 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 LINC00614P0C842 121 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 COTL1Q14019 142 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 SCXQ7RTU7 201 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 UBE2WQ96B02 151 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 KIR2DL4Q99706 377 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 FCER1GP30273 86 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 K7EMI3 77 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 ESDP10768 282 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 A0A087WX48 190 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 A0A096LNJ9 63 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 AMTP48728 403 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 PMCHL1Q16048 86 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 Q8N976 141 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 RMI2Q96E14 147 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 COX11Q9Y6N1 276 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 TMEM262E9PQX1 116 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 HSBP1O75506 76 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 ENHOQ6UWT2 76 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 S100A6P06703 90 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 MPV17L2Q567V2 206 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 TMEM243Q9BU79 118 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-212ENST00000485532 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 C5orf52A6NGY3 159 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 HBDP02042 147 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 TOMM6Q96B49 74 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 IFITM10A6NMD0 228 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 GAGE6Q13070 117 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 H7C423 109 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 USP17L23D6RBM5 183 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 CRPP02741 224 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 FGF6P10767 208 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 G0S2P27469 103 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 FAM104AQ969W3 186 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 TMEM18Q96B42 140 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-212ENST00000485532 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.17□□□□□ -1.1
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