RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 LCE1DQ5T752 114 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 FRZBQ92765 325 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 SLPIP03973 132 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS1P07477 247 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 PMCHP20382 165 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 REG3AQ06141 175 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 Q0VG73 95 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8N1X5 172 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 USP17L23D6RBM5 183 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 I3L3M4 83 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-DQA1P01909 254 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 MIAQ16674 131 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZSA8 131 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 BORCS7Q96B45 105 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 MRAP2Q96G30 205 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 COX11Q9Y6N1 276 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 CRPP02741 224 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 APCSP02743 223 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 FGF6P10767 208 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM104AQ969W3 186 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 RMI2Q96E14 147 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 ST20Q9HBF5 79 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM218A2RU14 115 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 PANO1I0J062 215 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2L6O14933 153 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 NPYP01303 97 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB14P61106 215 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 PKIAP61925 76 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 D6R8Y8 96 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 VCYO14598 125 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 HBBP68871 147 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 C15orf56Q8N910 161 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 H7C423 109 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 TCAPO15273 167 aa4.51□□□□□ -1.69
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RABGEF1-206ENST00000461017 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXI1Q12951 378 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 Q5VSD8 79 aa4.51□□□□□ -1.69
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RABGEF1-206ENST00000461017 SCXQ7RTU7 201 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 COMMD7Q86VX2 200 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
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RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GW15 77 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00862A6NCI5 91 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 EPM2AB3EWF7 344 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 F8W036 122 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R2P9O14990 202 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZUT4 128 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 hDV102S1A0JD36 115 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 CCL25O15444 150 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 MT-ND4LP03901 98 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 C14orf177Q52M58 125 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 UQCC3Q6UW78 93 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.49□□□□□ -1.69
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