RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, human

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00963-204	ENST00000427778	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	AMN1	Q8IY45	258 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	NRAC	Q8N912	160 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	ST20	Q9HBF5	79 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	LINC00862	A6NCI5	91 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	USP17L23	D6RBM5	183 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	PPP1R2P9	O14990	202 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	LINC00310	P59036	64 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	HLA-DQA1	P01909	254 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	FGF6	P10767	208 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	PMCH	P20382	165 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	HBB	P68871	147 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	C20orf78	Q9BR46	151 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778		F8W036	122 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	VCY	O14598	125 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	CAMP	P49913	170 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	IFITM2	Q01629	132 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	UQCC3	Q6UW78	93 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	SMKR1	H3BMG3	65 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	PHOX2A	O14813	284 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	TCAP	O15273	167 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	PPBP	P02775	128 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	MT-ND4L	P03901	98 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	PRSS1	P07477	247 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	CKS2	P33552	79 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	TMEM101	Q96IK0	257 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	BTF3L4	Q96K17	158 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778	KIR2DL4	Q99706	377 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINC00963-204	ENST00000427778		D6R8Y8	96 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	TNFRSF6B	O95407	300 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	FCER1G	P30273	86 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	LINC01620	Q4KN68	170 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	IMMP2L	Q96T52	175 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	TMEM218	A2RU14	115 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	CCL25	O15444	150 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	ADCYAP1	P18509	176 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	CFAP161	Q6P656	301 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	SCX	Q7RTU7	201 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	ORMDL3	Q8N138	153 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	C15orf56	Q8N910	161 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	hDV102S1	A0JD36	115 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	PRSS47	A8MTI9	375 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	NPY	P01303	97 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	HAMP	P81172	84 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	FOXI1	Q12951	378 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	SEC11C	Q9BY50	192 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	TMEM18	Q96B42	140 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	RNF213	Q63HN8	5207 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LINC00963-204	ENST00000427778	SLPI	P03973	132 aa		5.67	□□□□□ -1.5

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