RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZTC4 211 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 A0A096LPF7 62 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 NFE4Q86UQ8 179 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM262E9PQX1 116 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 TCTAP57738 103 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 HERVK_113P61574 105 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 DEFA6Q01524 100 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 SPATA45Q537H7 98 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 IGLC3P0DOY3 106 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 C11orf86A6NJI1 115 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 DLEU1O43261 78 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 HERVK_113P63121 156 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 GAGE6Q13070 117 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 FAM104AQ969W3 186 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 H3BRM9 83 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 K7EP13 123 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2D1P51668 147 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 ATOH7Q8N100 152 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 SIVA1O15304 175 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 COX8AP10176 69 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 CCL18P55774 89 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 RBX1P62877 108 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 SS18Q15532 418 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0J9YXV3 536 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 hDV102S1A0JD36 115 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 E9PLD3 99 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 ESRGQ1W209 222 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZUT4 128 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 STPG4Q8N801 248 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.6□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 NUPR2A6NF83 97 aa6.6□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.6□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM223A0PJW6 202 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 IGLL5B9A064 214 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 LEPROTO15243 131 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 DDTP30046 118 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 PRO1933Q9H354 126 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 NMUP48645 174 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 MAJINQ3KP22 176 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 MPV17L2Q567V2 206 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 C14orf144Q96I85 54 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 UPK3BQ9BT76 320 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 PRR34Q9NV39 138 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 REG3AQ06141 175 aa6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 SFTA2Q6UW10 78 aa6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 HIGD1BQ9P298 99 aa6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 TENM3Q9P273 2699 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 A0A087WZ39 114 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 MIAQ16674 131 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-211ENST00000425989 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.56□□□□□ -1.36
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