RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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POLR1A-204ENST00000424089 TCTAP57738 103 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2D3P61077 147 aa7.14□□□□□ -1.27
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POLR1A-204ENST00000424089 CEND1Q8N111 149 aa7.14□□□□□ -1.27
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POLR1A-204ENST00000424089 UBE2V1Q13404 147 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.13□□□□□ -1.27
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POLR1A-204ENST00000424089 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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POLR1A-204ENST00000424089 LYRM9A8MSI8 78 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-204ENST00000424089 J3QQQ9 107 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-204ENST00000424089 TIRAPP58753 221 aa7.11□□□□□ -1.27
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POLR1A-204ENST00000424089 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-204ENST00000424089 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.11□□□□□ -1.27
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POLR1A-204ENST00000424089 FAM104AQ969W3 186 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-204ENST00000424089 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-204ENST00000424089 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-204ENST00000424089 Q9UF83 564 aa7.11□□□□□ -1.27
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POLR1A-204ENST00000424089 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-204ENST00000424089 GAGE12JA6NER3 117 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2D1P51668 147 aa7.09□□□□□ -1.27
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POLR1A-204ENST00000424089 GAGE5Q13069 117 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-204ENST00000424089 GAGE13Q4V321 117 aa7.09□□□□□ -1.27
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POLR1A-204ENST00000424089 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0J9YY99 117 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1B0GWB2 263 aa7.08□□□□□ -1.28
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POLR1A-204ENST00000424089 MIFP14174 115 aa7.07□□□□□ -1.28
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POLR1A-204ENST00000424089 Q6ZUT4 128 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 C12orf74Q32Q52 190 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 Q6ZVH6 145 aa7.06□□□□□ -1.28
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POLR1A-204ENST00000424089 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 PRO0255Q9UI72 69 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PPM0 123 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 GAGE10A6NGK3 116 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM238C9JI98 176 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 H3BUT2 72 aa7.05□□□□□ -1.28
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