RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 F5H768 121 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2L6O14933 153 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 IGLC3P0DOY3 106 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 DDTP30046 118 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 TIRAPP58753 221 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 NFE4Q86UQ8 179 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 ATOH7Q8N100 152 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 hDV102S1A0JD36 115 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 DLEU1O43261 78 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 SEC11AP67812 179 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM101Q96IK0 257 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 PRO1933Q9H354 126 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 RETNQ9HD89 108 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-202ENST00000409024 RYR1P21817 5038 aa6.84□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GUV1 79 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 C11orf86A6NJI1 115 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 COX8AP10176 69 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 FGF6P10767 208 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 HERVK_113P61574 105 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0J9YWU9 116 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 SIVA1O15304 175 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 MAJINQ3KP22 176 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 FAM104AQ969W3 186 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 B9D2Q9BPU9 175 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 E9PLD3 99 aa6.81□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 CCL25O15444 150 aa6.81□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 STPG4Q8N801 248 aa6.81□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 HERC2O95714 4834 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 LCE6AA0A183 80 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 CASC10Q5T4H9 136 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 LELP1Q5T871 98 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 A0A096LPF7 62 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0J9YY99 117 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 HTN3P15516 51 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2D1P51668 147 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 HERVK_113P63121 156 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZTC4 211 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZUT4 128 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 C14orf144Q96I85 54 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 H3BRM9 83 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0J9YXV3 536 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM223A0PJW6 202 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00587B1AMM8 73 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 NMUP48645 174 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE6Q13070 117 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 HIGD1BQ9P298 99 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 LEPROTO15243 131 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 MUC7Q8TAX7 377 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM262E9PQX1 116 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 M0R143 59 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 RBX1P62877 108 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.74□□□□□ -1.33
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