RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 TWIST1Q15672 202 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 FAM168BA1KXE4 195 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 XKRY2A2RUG3 117 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 GIPP09681 153 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 C9orf62Q8N4C0 152 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 FAM213BQ8TBF2 198 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 PMCHP20382 165 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf48Q96LS8 159 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXD12-201ENST00000404162 RAB19A4D1S5 217 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 COX7A2LO14548 114 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 CTRLP40313 264 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 I3L3M4 83 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf52Q96A22 123 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 TSHBP01222 138 aa11.43□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 TSKUQ8WUA8 353 aa11.43□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 CNFNQ9BYD5 112 aa11.43□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 RNF151Q2KHN1 245 aa11.42□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 MRAP2Q96G30 205 aa11.42□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM242Q9NWH2 141 aa11.42□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 G3V3Q6 166 aa11.41□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 C5orf38Q86SI9 138 aa11.41□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf196B1AJZ1 125 aa11.4□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 SPAG11BQ08648 103 aa11.4□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.4□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 NUDT10Q8NFP7 164 aa11.4□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 NUDT11Q96G61 164 aa11.4□□□□□ -0.58
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.39□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 ARPC5O15511 151 aa11.39□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11.39□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 GNG4P50150 75 aa11.39□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 CCL20P78556 96 aa11.39□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 FSIP2Q5CZC0 6907 aa11.38□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 TEX261Q6UWH6 196 aa11.38□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM12Q96EX1 92 aa11.38□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa11.37□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 UMAD1C9J7I0 102 aa11.37□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 GNG13Q9P2W3 67 aa11.37□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2BP63146 152 aa11.36□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM15Q7Z3B0 74 aa11.36□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 CRCT1Q9UGL9 99 aa11.36□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 C10orf25Q5T742 122 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 IMMP2LQ96T52 175 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 ST20Q9HBF5 79 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 MANBALQ9NQG1 85 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 C7orf77A4D0Y5 90 aa11.34□□□□□ -0.59
HOXD12-201ENST00000404162 M0QXV9 152 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 TLX1NBP0CAT3 122 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 GAGE2EQ4V326 116 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 BIN3Q9NQY0 253 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 OR10D4PQ8NGN7 298 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 FAM210AQ96ND0 272 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 A0A087X002 238 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF861PO60384 105 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 ORAOV1Q8WV07 137 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 RETNLBQ9BQ08 111 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 MED9Q9NWA0 146 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFA1O15239 70 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 Q6ZUT4 128 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 CDIP1Q9H305 208 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 F8WDY8 70 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 SMLR1H3BR10 107 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM241Q24JQ0 296 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXD12-201ENST00000404162 K7EN84 100 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 PDE6DO43924 150 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 OCC1Q8TAD7 63 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 FCER1GP30273 86 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF345Q14585 488 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 TPRXLQ17RH7 258 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 VCYO14598 125 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 CRYGAP11844 174 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 RAB4AP20338 218 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 SMKR1H3BMG3 65 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXD12-201ENST00000404162 GATCO43716 136 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0087Q14695 138 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 FAM104AQ969W3 186 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TIMM21Q9BVV7 248 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.5 ms